Liza Loves Biology
08.02.202508:53
Страшные вещи творятся в одном из аквариумов в штате Луизиана. В аквариуме, где жили только две акулы-самки на протяжении нескольких лет в условиях жесткого целибата, без самцов, внезапно появился детеныш. Похоже, этот "акуленок" появился на свет в аквариуме в результате партеногенеза. Да, случаи партеногенеза у акул известны, но не при таких странных обстоятельствах. Будем надеяться, что ясность в происхождении этого детеныша может внести генетический анализ. Воистину нет в биологии правил без исключений.
30.01.202516:49
Не могу не поделиться еще одной новостью из Аптекарского огорода МГУ. Там на днях распустилось очень неординарного вида растение — орхидея из рода дракула (лат. Dracula). Не могу сказать, что меня внешний вид этого растения пугает, но что-то в этой орхидее все-таки есть.
24.01.202517:05
Стать ML-щиком за неделю… нереально, но можно пройти бесплатный 🔥 ML Bootcamp от OpenBio! 🔥
С 3 по 9 февраля этот канал превратится в тренировочную площадку, где ваши умы будут кипеть, а клавиатуры — дымиться. ;)
В течение пяти дней мы будем публиковать фрагменты материалов из курса «Машинное обучение в биологии и биомедицине», один день — один модуль.
Также участников ML Bootcamp ждет:
🔥 карьерный вебинар «Прожарка вакансий» с честным разбором актуальных вакансий из сферы биотеха от продюсера образовательных курсов и эксперта по карьерным трекам в биотехе Натальи Мнафки и Даниила Игумнова (Data Scientist, ex Vivan Therapeutics, ex Armenian Bioinformatics Institute);
🔥 тестирование для тех, кто захочет закрепить полученные знания;
🔥 возможность получить скидку до 30% на обучение на курсе «Машинное обучение в биологии и биомедицине»!
Подписывайтесь на канал, приглашайте друзей, включайте уведомления, и уже 3 февраля мы встретимся на самом горячем мероприятии этой зимы — ML Bootcamp от OpenBio!
#openbio_ML_Bootcamp
#openbio_ml #openbio_education
🔥 До старта 🌤🌥☁️ от OpenBio: 10 дней.🔥
Машинное обучение в биологии и биомедицине | OpenBio.Edu — подписывайтесь!
С 3 по 9 февраля этот канал превратится в тренировочную площадку, где ваши умы будут кипеть, а клавиатуры — дымиться. ;)
В течение пяти дней мы будем публиковать фрагменты материалов из курса «Машинное обучение в биологии и биомедицине», один день — один модуль.
Используйте возможность изучить часть материалов платного курса, пока они в открытом доступе!
Также участников ML Bootcamp ждет:
🔥 карьерный вебинар «Прожарка вакансий» с честным разбором актуальных вакансий из сферы биотеха от продюсера образовательных курсов и эксперта по карьерным трекам в биотехе Натальи Мнафки и Даниила Игумнова (Data Scientist, ex Vivan Therapeutics, ex Armenian Bioinformatics Institute);
🔥 тестирование для тех, кто захочет закрепить полученные знания;
🔥 возможность получить скидку до 30% на обучение на курсе «Машинное обучение в биологии и биомедицине»!
Подписывайтесь на канал, приглашайте друзей, включайте уведомления, и уже 3 февраля мы встретимся на самом горячем мероприятии этой зимы — ML Bootcamp от OpenBio!
#openbio_ML_Bootcamp
#openbio_ml #openbio_education
🔥 До старта 🌤🌥☁️ от OpenBio: 10 дней.🔥
Машинное обучение в биологии и биомедицине | OpenBio.Edu — подписывайтесь!
Пераслаў з:
Нейрокампус
Не змаглі атрымаць доступ
да медыяконтэнту
да медыяконтэнту
11.11.202416:10
🦅 Друзья! В следующий четверг, 14 ноября, в 18:30 (обратите внимание, что не в 18:00, как обычно), состоится лекция Екатерины Диффинэ, аспирантки биологического факультета МГУ и сотрудника института перспективных исследований мозга МГУ. Темой лекции будут мозг и мышление птиц.
📆 Когда: 14 ноября, 18:30
📍 Где: Федеральный центр мозга и нейротехнологий, улица Островитянова, 1, стр. 10.
❗️ Для посещения лекции необходима регистрация по ссылке, которая закрывается 14 ноября в 12:30. Для прохода в здание не забудьте взять паспорт!
🎬 Как обычно, запись лекции будет доступна и опубликована на нашей странице в VK, также на канале Нейрокампуса в Rutube. Ссылка на трансляцию будет выложена позднее.
📆 Когда: 14 ноября, 18:30
📍 Где: Федеральный центр мозга и нейротехнологий, улица Островитянова, 1, стр. 10.
❗️ Для посещения лекции необходима регистрация по ссылке, которая закрывается 14 ноября в 12:30. Для прохода в здание не забудьте взять паспорт!
🎬 Как обычно, запись лекции будет доступна и опубликована на нашей странице в VK, также на канале Нейрокампуса в Rutube. Ссылка на трансляцию будет выложена позднее.
08.11.202407:23
История "бессмертной" медузы Turritopsis dohrnii, которая может до бесконечности переходить из стадии полипа в стадию медузы и обратно, уже стала широко известна. Но в недавнем исследовании было показано, что "бессмертными" могут быть и гребневики! Гребневик Mnemiopsis leidyi, как выяснилось, умеет легко и непринужденно превращаться из взрослой особи в личинку, когда наступают не лучшие времена, и обратно. Так что этого гребневика с некоторой натяжкой тоже можно считать "бессмертным". Я уже не раз упоминала, что гребневики не перестают удивлять, и пока они уверенно держат эту планку.
Не змаглі атрымаць доступ
да медыяконтэнту
да медыяконтэнту
25.10.202409:50
Недавно узнала про одно необычное состояние — синдром нерасчесываемых волос. При этом состоянии волосы имеют неправильное сечение, а именно, треугольное вместо круглого, и потому топорщатся во все стороны без шансов уложить или расчесать их (однако убрать в прическу их все-таки удается). Чаще всего синдром нерасчесываемых волос встречается у светловолосых людей. Как часто он встречается в целом, определить сложно: если у ребенка плохо расчесываются волосы, мало какая мама потащит чадо с этой проблемой к врачу.
04.02.202517:52
Определение пола — одна из самых увлекательных, на мой взгляд, областей генетики. Разнообразие механизмов — от хромосомного до условий внешней среды — поражает воображение. Но самое удивительное состоит в том, что порой эволюционно близкие организмы имеют разные механизмы определения пола. У одних млекопитающих их куча, а уж про рыб я вообще молчу. Новые, раньше неизвестные механизмы определения пола описывают и сейчас. Например, давеча в Current Biology вышла интереснейшая работа об определении пола у головоногих моллюсков. У них, как было показано, самки имеют кариотип ZO, а самцы — ZZ. Более того, Z-хромосома головоногих буквально набита повторами и мобильными элементами, а в остальном геноме плотность этих элементов вдвое меньше. Оказалось, что вот эта громоздкая Z-хромосома с кучей мобильных элементов в ходе эволюции головоногих появилась очень рано и была уже у наутилуса. Авторы работы говорят, что, возможно, Z-хромосома головоногих — одна из самых древних половых хромосом, по крайней мере, из тех, что пока мы знаем.
28.01.202517:17
Как же порой тянет провести параллели между нашими поведенческими реакциями и таковыми у братьев наших меньших. Возьмем, к примеру, бабуинов. Недавнее исследование показало, что у альфа-самцов бабуинов повышенный уровень гормонов стресса, и основная причина — вовсе не поддержание доминирующего положения среди других самцов. Причина кроется во взаимодействии с самками. Так что можно быть первым парнем на деревне, но это не означает, что тебе никто не проест плешь из-за разбросанных грязных носков. Я очень утрирую, конечно, но все же.
21.01.202515:01
Мы склонны считать, что у сложного организма должен быть и не менее сложный геном, в частности, по количеству генов. Конечно, человек, как казалось, должен быть в первых рядах! Однако в результате легендарного проекта "Геном человека" было показано, что, к удивлению всех, человеческий геном оказался очень небольшим, и в его состав входит всего лишь от 20 до 30 (или 25) тысяч генов. Более того, выяснилось, что ряд организмов с гораздо меньшей "развитостью" имеет то же, если не большее, число генов, чем у нас с вами. Так, в составе одного только генома кукурузы идентифицировали 33 тысяч генов!
Ну, хорошо, небольшой геном у нас с вами, мы смирились и приняли ситуацию. Но в конце прошлого года вышла работа (пока еще она имеет статус препринта), которая, наряду с некоторыми другими, показывает: в геноме человека содержатся тысячи ранее не известных генов! Более того, они активны, и с них считываются так называемые минибелки, которые объединяют в группу "темный протеом". Ключевую роль в работе составило изучение неканонических открытых рамок считывания (nORF от англ. Open Reading Frame), с которой и считывается пресловутый темный протеом, с помощью самых разных методов, как биоинформатических, так и методов молекулярной и клеточной биологии. В 2022 году в геноме человека обнаружили 7264 новых nORF. Теперь же, по оценкам авторов новой статьи, всего в генов геноме человека не более чем 100000, или, с меньшей вероятностью, 50000 тысяч генов.
Стоит, однако, отметить, что авторы обсуждаемой работы вовсе не являются пионерами в описании новых человеческих генов и минибелков. Так, три года назад на клеточных культурах были описаны 550 новых минибелков. Однако в новом исследовании с привлечением самых разных методов удалось детальнее охарактеризовать новые неканонические рамки считывания и их белковые продукты. В частности, в ходе разгребанияавгиевых конюшен темного протеома было показано, что не менее 25% от 7264 новых ORF транслируются. То ли еще будет!
Ну, хорошо, небольшой геном у нас с вами, мы смирились и приняли ситуацию. Но в конце прошлого года вышла работа (пока еще она имеет статус препринта), которая, наряду с некоторыми другими, показывает: в геноме человека содержатся тысячи ранее не известных генов! Более того, они активны, и с них считываются так называемые минибелки, которые объединяют в группу "темный протеом". Ключевую роль в работе составило изучение неканонических открытых рамок считывания (nORF от англ. Open Reading Frame), с которой и считывается пресловутый темный протеом, с помощью самых разных методов, как биоинформатических, так и методов молекулярной и клеточной биологии. В 2022 году в геноме человека обнаружили 7264 новых nORF. Теперь же, по оценкам авторов новой статьи, всего в генов геноме человека не более чем 100000, или, с меньшей вероятностью, 50000 тысяч генов.
Стоит, однако, отметить, что авторы обсуждаемой работы вовсе не являются пионерами в описании новых человеческих генов и минибелков. Так, три года назад на клеточных культурах были описаны 550 новых минибелков. Однако в новом исследовании с привлечением самых разных методов удалось детальнее охарактеризовать новые неканонические рамки считывания и их белковые продукты. В частности, в ходе разгребания
11.11.202408:18
Сферы влияния бывают не только в геополитике. Недавно было показано, как два паразитических грибка, Metarhizium robertsii ARSEF 2575 (Mr2575) и Metarhizium anisopliae ARSEF 549 (Ma549), ведут себя, если одновременно заражают один и тот же организм, служащий им хозяином. Паразитируют они преимущественно насекомых, но иногда они взаимодействуют с растениями. Когда дела плохи и питательных веществ мало, Mr2575 оттесняет своего конкурента, Ma549, на второй план: так происходит, в частности, при инфицировании корней арабидопсиса. Если же грибки заражают насекомое, происходит нечто неожиданное: они словно бы делят организм хозяина на отдельные зоны, каждая из которых закреплена за определенным грибком. Как было показано на дрозофилах, Mr2575 предпочитает колонизировать трахеи, особенно у самок, а Ma549 захватывает брюшко. Вот такая вот геополитика у паразитических грибков.
07.11.202414:23
Как я неоднократно отмечала, мне всегда очень радостно, когда сейчас, несмотря на крайне тяжелые условия, российские ученые продолжают публиковаться в крутых журналах, как, например, группа Аллы Красиковой, которая недавно опубликовала статью в Nucleic Acids Research! Работа посвящена полногеномному транскрипционному профилю хромосом типа ламповых щеток в куриных ооцитах (когда-то я уже писала об этих в высшей степени необычных хромосомах). Вот что Алла рассказывает об этой работе:
Вывод из нашей работы можно кратко сформулировать в одной фразе: на хромосомах типа ламповых щеток птиц происходит транскрипция более чем 10000 генов. Далее мы подробно обсуждаем, какие именно гены транскрибируются на этой стадии оогенеза, какова судьба этих транскриптов, почему происходит и как может регулироваться гипертранскрипция белок-кодирующих генов и генов некодирующей РНК на латеральных петлях хромосом типа ламповых щеток. Наиболее неожиданным наблюдением оказалось то, что транскрипция, происходящая на хромосомах типа ламповых щеток, в целом сходна с транскрипцией во многих других типах клеток с точки зрения основных регуляторных механизмов и спектра транскрибируемых последовательностей. Однако благодаря необычно высокой интенсивности транскрипции и гигантским размерам хромосомы типа ламповых щеток могут быть использованы в качестве удобной модели для изучения экспрессии генов, регуляции транскрипции, процессинга РНК, динамики образования транскрипционных петель и формирования хроматиновых доменов. Кроме того, мы также уделяем внимание транскрипции тандемно повторяющихся последовательностей в центромерных и теломерных районах хромосом, которую раньше демонстрировали только на цитологическом уровне. В настоящей работе мы определили, что диспергированные ретротранспозоны могут выступать в качестве промоторов для транскрипции части кластеров тандемных повторов.
Поздравляем!
Вывод из нашей работы можно кратко сформулировать в одной фразе: на хромосомах типа ламповых щеток птиц происходит транскрипция более чем 10000 генов. Далее мы подробно обсуждаем, какие именно гены транскрибируются на этой стадии оогенеза, какова судьба этих транскриптов, почему происходит и как может регулироваться гипертранскрипция белок-кодирующих генов и генов некодирующей РНК на латеральных петлях хромосом типа ламповых щеток. Наиболее неожиданным наблюдением оказалось то, что транскрипция, происходящая на хромосомах типа ламповых щеток, в целом сходна с транскрипцией во многих других типах клеток с точки зрения основных регуляторных механизмов и спектра транскрибируемых последовательностей. Однако благодаря необычно высокой интенсивности транскрипции и гигантским размерам хромосомы типа ламповых щеток могут быть использованы в качестве удобной модели для изучения экспрессии генов, регуляции транскрипции, процессинга РНК, динамики образования транскрипционных петель и формирования хроматиновых доменов. Кроме того, мы также уделяем внимание транскрипции тандемно повторяющихся последовательностей в центромерных и теломерных районах хромосом, которую раньше демонстрировали только на цитологическом уровне. В настоящей работе мы определили, что диспергированные ретротранспозоны могут выступать в качестве промоторов для транскрипции части кластеров тандемных повторов.
Поздравляем!
23.10.202409:33
Тут подвезли очередную прекрасную вещь о жизни на Марсе. На Земле солнечный свет проникает в лед на некоторую глубину, в зависимости от его оптических свойств, поэтому организмы, обитающие во льду, могут фотосинтезировать, а озоновый счет обеспечивает их защиту от ультрафиолета. А возможно ли такое на Марсе? В отсутствие защитного озонового слоя ультрафиолет там жарит нещадно и, казалось бы, шансов на фотосинтез там маловато. Но, как показало моделирование, фотосинтетические организмы могут обитать в так называемом "пыльном льду", иными словами, в плотных пыльных частицах снега. Если на тех глубинах марсианского льда, где есть пыльный лед, есть еще и жидкая вода, можно считать, что на Марсе может существовать относительно подходящая ниша для обитания фотосинтезирующих организмов.
01.02.202513:13
Новость о том, что микроскопические организмы могут поселяться внутри насекомых и даже менять их поведение, не откровение — чего одна вольбахия стоит! Но, как показало новое исследование, не только насекомые, но и паукообразные могут становиться жертвами микроскопических патогенов. Недавно в пещере в Северной Ирландии был описан новый вид грибков, который поражает именно пауков. Этот вид получил название Gibellula attenboroughii. Его гифы буквально прорастают внутрь тела своих пауков-жертв и благодаря этому могут оказывать влияние на поведение хозяина (на фото — инфицированный паук). Но, с другой стороны, паразитическому грибку как-то все-таки удается пробиться через плотную кутикулу хозяина и пробуравливать его тело. Может быть, его ферменты и метаболиты каким-то образом могут быть использованы человеком?
26.01.202513:06
А вот эту красоту получили японские ученые: целых двадцать флуоресцентных цветов! Для их создания использовались попарно связанные флуоресцентные белки.
12.11.202414:44
Очень необычная работа вышла недавно в Nature Communications за первым авторством Николая Кукушкина (да-да, это который "Хлопок одной ладонью" написал). Оказывается, память в ее узком смысле, в плане передачи сигнала между клетками, не является прерогативой нейронов. Авторы работы смогли продемонстрировать, что молекулярные задатки памяти есть и у культивируемых клеток! Ученые поливали их двумя разными химическими веществами и регистрировали ответ на них с помощью люциферазы, которая была помещена под промотор гена CREB — одного из ключевых факторов формирования нашей с вами памяти. Таким образом было показано, что клетки "запоминали" вещества, с которыми им довелось столкнуться, благодаря CREB и протеинкиназе ERK, которые необходимы для формирования памяти и у нас. Похоже, память в широком смысле опирается на определенные сигнальные пути, и нейроны в этом отношении неуникальны.
10.11.202407:03
Оспа была официально объявлена ликвидированной в 1980 году. Считается, что сейчас вирус той самой оспы, которая долгие века именовалась не иначе как "черная смерть", хранится всего в двух лабораториях в мире: у нас в стране в ГНЦ вирусологии и биотехнологии "Вектор" и в США в Центрах по контролю и профилактики заболеваний. Однако с тех пор время от времени пробирки с вирусом оспы находят совсем не там, где им надлежало бы быть... Оговорюсь сразу: это не конспирология, это вполне реальные факты.
Так, в 2014 году весь мир вздрогнул, когда уборщики нашли в Национальных институтах здравоохранения в Бетесде (США) в одном из складов несколько пробирок с вирусом оспы (на них так и было написано: "оспа"). Тревога оказалась ложной: пробирки были должным образом запечатаны и, по всей видимости, несколько десятилетий (может, даже с 1950-х годов) хранились без холода, и вряд ли в них сохранился жизнеспособный вирус. Скорее всего, их просто забыли в помещении, не предназначенном для хранения подобных агентов, и вряд ли это был жест устрашения, как в истории о рассылке спор сибирской язвы. Однако через семь лет, в 2021 году история повторилась: в США опять были найдены бесхозные пробирки с вирусом оспы, на этот раз в Пенсильвании, в одной лаборатории, занимающейся разработкой вакцин. Если в 2014 году вероятный безобидный сценарий оставления пробирок с вирусом оспы там, где ему не следует быть, еще можно придумать, то в случае с обнаружением вируса в Пенсильвании ситуация остается загадочной и сейчас. Дело в том, что нашли их при уборке холодильной камеры, то есть, в отличие от находки 2014 года, температурный режим был сохранен, хотя пробирки остались герметичными. На фоне оспы обезьян, о которой сейчас говорят все больше, эти находки внушают все большую тревогу...
Так, в 2014 году весь мир вздрогнул, когда уборщики нашли в Национальных институтах здравоохранения в Бетесде (США) в одном из складов несколько пробирок с вирусом оспы (на них так и было написано: "оспа"). Тревога оказалась ложной: пробирки были должным образом запечатаны и, по всей видимости, несколько десятилетий (может, даже с 1950-х годов) хранились без холода, и вряд ли в них сохранился жизнеспособный вирус. Скорее всего, их просто забыли в помещении, не предназначенном для хранения подобных агентов, и вряд ли это был жест устрашения, как в истории о рассылке спор сибирской язвы. Однако через семь лет, в 2021 году история повторилась: в США опять были найдены бесхозные пробирки с вирусом оспы, на этот раз в Пенсильвании, в одной лаборатории, занимающейся разработкой вакцин. Если в 2014 году вероятный безобидный сценарий оставления пробирок с вирусом оспы там, где ему не следует быть, еще можно придумать, то в случае с обнаружением вируса в Пенсильвании ситуация остается загадочной и сейчас. Дело в том, что нашли их при уборке холодильной камеры, то есть, в отличие от находки 2014 года, температурный режим был сохранен, хотя пробирки остались герметичными. На фоне оспы обезьян, о которой сейчас говорят все больше, эти находки внушают все большую тревогу...
06.11.202407:17
Смотрите, что делается... Создали особые наночастицы, внутри которых — цитотоксические агенты, которые выделяют разъяренные NK-клетки, а именно, гранзим B и перфорины. Против такого спецназа бессилен даже золотистый стафилококк, забившийся внутрь клеток организма-хозяина и устойчивый аж к самому ванкомицину. Авторы работы надеются, что их подход будет эффективен и при других инфекциях, при которых патогены находятся внутри клеток организма-хозяина. До клиники тут, конечно, невероятно далеко, но идея красивая.
22.10.202409:27
Нет наследника престола — значит, смута. Простая истина, которая мучила монархов всех стран. Жена монарха или его наследника просто обязана была произвести на свет мальчика, иначе во многих странах участь ее была незавидна. Во времена жестокие и грубые интуитивно понятная равная или почти равная вероятность рождения мальчика или девочки часто не бралась в расчет. А вот недавно американские ученые показали, что соотношение полов во многих популяциях подчиняется генетике и даже нашли два гена, связанных с этим соотношением! Один из них, RLF является активатором транскрипции, а второй, KIF20B, кодирует кинезиноподобный белок.
31.01.202512:48
В XIX веке на Ирландию обрушилось настоящее бедствие. Страна, не представляющая жизни без картофеля, почти в одночасье его лишилась: фитофтора (Phytophthora infestans) уничтожила все посадки, и в стране начался тяжелый голод. Но что за фитофтора это была? Почему она обрушилась именно на Ирландию? Недавнее исследование показало, что фитофтора, ответственная на голод в Ирландии, родом из Южной Америки, точнее, из Анд. Бушевала она не только в Ирландии, но также Мексике и Андах, откуда она и родом.
25.01.202512:02
Развод и девичья фамилия бывают не только у людей. Как недавно было показано, у малых пингвинов (род Eudyptula) есть похожая поведенческая реакция (разве что девичьей фамилии нет). Считалось, что малые пингвины образуют стойкие пары, порой на всю жизнь. Но авторы одной недавней работы наблюдали за целыми 13 (!) периодами размножения малых пингвинов с 2000 по 2012 год и выяснили, что малые пингвины вида Eudyptula minor имеют не самое чистое облико морале, а представление о малых пингвинах как о моногамных (ну, или моногамных на несколько периодов размножения) животных оказалось неверным. И самцы, и самки зачастую заводят пары на стороне. Тем не менее, "разводы" у малых пингвинов довольно распространены и вовсе не по причине супружеской неверности: исследователям удалось установить, что на тысячу пар происходят около 250 "разводов". Правда, причины разрыва отношений у малых пингвинов совершенно прозаичны: небольшое количество яиц, которые снесла самка, и стресс, связанный с ухудшением условий окружающей среды.
11.11.202416:46
И вновь напоминаю о прекрасной возможности попробовать себя в научпопе, которую ежегодно предоставляет Биомолекула @biomolecula!
✍️🧬 Друзья, если вы любите науку так же, как и мы, и хотите рассказать об этом, у нас для вас отличная новость! Наши коллеги из «Биомолекулы» зовут вас принять участие в 14-м сезоне конкурса научно-популярных работ о современной биологии — «Био|Мол|Текст».
🔥 Если вы всегда мечтали увлекательно рассказать, ярко проиллюстрировать или оригинально снять что-то, связанное с биологией, этот конкурс — для вас! Во-первых, это престижно, во-вторых, общественно полезно а, в-третьих, вы можете выиграть до 50 000 рублей (а это просто приятно).
Цель конкурса — предоставить возможности для профессионального развития как уже известным авторам, так и тем, кто только пробует себя в этой роли, независимо от профессии. «Био|Мол|Текст» – одно из самых авторитетных событий в области популяризации науки.
Конкурс уже не первый год собирает лучших авторов, которые рассказывают о науке простым и понятным языком 🧬
‼️ Приём работ — до 1 декабря 2024 года. Все подробности на сайте Биомолекулы: https://biomolecula.ru/biomoltext/bio-mol-tekst-2024
Не упустите возможность внести свой вклад в развитие науки и образования уже сегодня!
✍️🧬 Друзья, если вы любите науку так же, как и мы, и хотите рассказать об этом, у нас для вас отличная новость! Наши коллеги из «Биомолекулы» зовут вас принять участие в 14-м сезоне конкурса научно-популярных работ о современной биологии — «Био|Мол|Текст».
🔥 Если вы всегда мечтали увлекательно рассказать, ярко проиллюстрировать или оригинально снять что-то, связанное с биологией, этот конкурс — для вас! Во-первых, это престижно, во-вторых, общественно полезно а, в-третьих, вы можете выиграть до 50 000 рублей (а это просто приятно).
Цель конкурса — предоставить возможности для профессионального развития как уже известным авторам, так и тем, кто только пробует себя в этой роли, независимо от профессии. «Био|Мол|Текст» – одно из самых авторитетных событий в области популяризации науки.
Конкурс уже не первый год собирает лучших авторов, которые рассказывают о науке простым и понятным языком 🧬
‼️ Приём работ — до 1 декабря 2024 года. Все подробности на сайте Биомолекулы: https://biomolecula.ru/biomoltext/bio-mol-tekst-2024
Не упустите возможность внести свой вклад в развитие науки и образования уже сегодня!
09.11.202408:09
Пока кто-то усиленно ищет признаки жизни на Марсе и других небесных телах, другие не менее усиленно изучают земную жизнь, скрытую в самых неожиданных местах. И, надо сказать, порой находят такое, с чем никакая жизнь на Марсе не сравнится (по крайней мере, пока). Давеча вышла очень любопытная статья, авторы которой нашли в глубоководном коралле Callogorgia delta двух крайне необычных бактериальных симбионтов, которые, по всей видимости, живут в мезоглее своего хозяина. Эти симбионты — микоплазмы с сильно редуцированными геномами, и они дошли даже до того, что генов, кодирующих ферменты, в их геномах практически не осталось, и они не могут усваивать углеводы и получать из них энергию. Они неспособны к гликолизу, и единственный источник энергии для них — аргинин, которым их обеспечивает коралл. Тем не менее, они снабжены системами рестрикции-модификации и имеют локусы CRISPR. Авторы работы определили новооткрытых симбионтов в специально созданное под них семейство Oceanoplasmataceae. И, по всей видимости, это только начало: скорее всего, похожих симбиотических микоплазм с маленькими геномами и скудным набором генов, связанных с метаболизмом, существует немало.
26.10.202408:26
В продолжение темы волос не могу не затронуть один момент. У меня всю жизнь были абсолютно прямые волосы. Но за последние несколько месяцев я совершенно неожиданно для себя и окружающих постепенно стала счастливым обладателем курчавой гривы, которая с трудом расчесывается, а когда воздух влажный, она и вовсе выходит из-под контроля и начинает виться буклями, как на париках XVIII века (средства по уходу за волосами я не меняла). Мой папа тоже кудрявый, но почему тогда наследственность вылезла лишь на 28-м году жизни? Мне стало так интересно, что я решила разобраться, что же не так с кудрявыми волосами.
Принято считать, что курчавые волосы — аутосомно-доминантный признак, который наследуется чуть ли не по Менделю. Реальность, как часто бывает, оказалась существенно сложнее. Наличие курчавости и ее вид, то есть степень закрученности волос, у человека определяется свойствами волосяного фолликула, и у кудрявых волос фолликулы, как правило, асимметричны. Более того, асимметричности фолликула можно добиться разными способами при участии конкретных генов, точнее, однонуклеотидных полиморфизмов в этих генах (хорошая таблица с генами и вообще качественный разбор темы есть в статье). В общем, за кудрявостью волос стоит большая наука, но почему я вдруг стала кудрявой, я так и не поняла...
Принято считать, что курчавые волосы — аутосомно-доминантный признак, который наследуется чуть ли не по Менделю. Реальность, как часто бывает, оказалась существенно сложнее. Наличие курчавости и ее вид, то есть степень закрученности волос, у человека определяется свойствами волосяного фолликула, и у кудрявых волос фолликулы, как правило, асимметричны. Более того, асимметричности фолликула можно добиться разными способами при участии конкретных генов, точнее, однонуклеотидных полиморфизмов в этих генах (хорошая таблица с генами и вообще качественный разбор темы есть в статье). В общем, за кудрявостью волос стоит большая наука, но почему я вдруг стала кудрявой, я так и не поняла...
10.09.202415:57
Я всегда очень радуюсь, когда у российских ученых выходят крутые публикации, пусть и в коллаборации с исследователями из других стран (особенно сейчас по понятным всем причинам). Вчера у группы Ивана Кулаковского и коллег вышла замечательная статья в Nature Communications. Один из первых авторов, Андрей Буян, рассказывает об исследовании:
Изучение регуляции активности генов ДНК-распознающими факторами транскрипции является хоть и не тривиальной, но уже привычной задачей, для решения которой существуют популярные экспериментальные и вычислительные методы с общепринятыми протоколами их использования. В то же время исследование пост-транскрипционной регуляции существенно отстает и анализ РНК-связывающих белков (РСБ) по сей день остается проблемой для многих научных групп. Так, лишь у малого числа РСБ определены четкие паттерны их участков связывания: белку для взаимодействия с РНК может быть нужна или определенная структура, или модификация, или другой белок-партнер, или же его взаимодействие с мишенью возможно только в пределах конкретного клеточного компартмента. Функциональное разнообразие последствий РНК-белковых взаимодействий так же велико: они могут влиять на синтез РНК, ее созревание, транспорт, трансляцию, стабильность, или же на несколько этапов сразу.
В нашей работе для аннотации РНК-связывающих белков мы совместили 3 модальности, характеризующие функциональность РСБ: информацию об их РНК-мишенях, знание их белковых партнеров, и последствия нокдауна генов этих белков с точки зрения транскриптома — "молекулярного фенотипа" клетки.
В итоге мы построили мультимодальную карту, отражающую степени функциональной близости сотни РСБ, что позволило установить их общие мишени и охарактеризовать вовлеченность в те или иные биологические процессы, выявив как каноничные функции этих белков, так и неожиданные новые ипостаси.
Например, мы предсказали и подтвердили, что фактор транскрипции TAF15 и белок ZC3H11A, компонент комплекса TREX, участвующего в экспорте мРНК из ядра, вовлечены в сплайсинг связываемых ими молекул РНК. При этом TAF15 оказался мультифункциональным: он также вовлечен в регуляцию трансляции и стабильности РНК-мишеней.
В то же время для РНК-связывающих белков QKI (известен как фактор сплайсинга РНК) и ZNF800 (ранее не аннотирован) наш подход позволили выявить их прямую вовлеченность в регуляцию транскрипции генов.
Надеемся, что полученные в ходе этой работы экспериментальные данные и результаты помогут научному сообществу в дальнейшем изучении и функциональной аннотации РНК-связывающих белков, включенных в наш "мультимодальный атлас сходства".
❗️ Если вы хотите рассказать о своем исследовании в рамках этого канала или просто поделиться публикациями, которые вас зацепили — пишите мне @lizaminina.
Изучение регуляции активности генов ДНК-распознающими факторами транскрипции является хоть и не тривиальной, но уже привычной задачей, для решения которой существуют популярные экспериментальные и вычислительные методы с общепринятыми протоколами их использования. В то же время исследование пост-транскрипционной регуляции существенно отстает и анализ РНК-связывающих белков (РСБ) по сей день остается проблемой для многих научных групп. Так, лишь у малого числа РСБ определены четкие паттерны их участков связывания: белку для взаимодействия с РНК может быть нужна или определенная структура, или модификация, или другой белок-партнер, или же его взаимодействие с мишенью возможно только в пределах конкретного клеточного компартмента. Функциональное разнообразие последствий РНК-белковых взаимодействий так же велико: они могут влиять на синтез РНК, ее созревание, транспорт, трансляцию, стабильность, или же на несколько этапов сразу.
В нашей работе для аннотации РНК-связывающих белков мы совместили 3 модальности, характеризующие функциональность РСБ: информацию об их РНК-мишенях, знание их белковых партнеров, и последствия нокдауна генов этих белков с точки зрения транскриптома — "молекулярного фенотипа" клетки.
В итоге мы построили мультимодальную карту, отражающую степени функциональной близости сотни РСБ, что позволило установить их общие мишени и охарактеризовать вовлеченность в те или иные биологические процессы, выявив как каноничные функции этих белков, так и неожиданные новые ипостаси.
Например, мы предсказали и подтвердили, что фактор транскрипции TAF15 и белок ZC3H11A, компонент комплекса TREX, участвующего в экспорте мРНК из ядра, вовлечены в сплайсинг связываемых ими молекул РНК. При этом TAF15 оказался мультифункциональным: он также вовлечен в регуляцию трансляции и стабильности РНК-мишеней.
В то же время для РНК-связывающих белков QKI (известен как фактор сплайсинга РНК) и ZNF800 (ранее не аннотирован) наш подход позволили выявить их прямую вовлеченность в регуляцию транскрипции генов.
Надеемся, что полученные в ходе этой работы экспериментальные данные и результаты помогут научному сообществу в дальнейшем изучении и функциональной аннотации РНК-связывающих белков, включенных в наш "мультимодальный атлас сходства".
❗️ Если вы хотите рассказать о своем исследовании в рамках этого канала или просто поделиться публикациями, которые вас зацепили — пишите мне @lizaminina.
Паказана 1 - 24 з 29
Увайдзіце, каб разблакаваць больш функцый.