✏️تمرکز: توالی‌های نوکلئوتیدی (DNA/RNA).
⏺مرور: یک پایگاه داده پایه ای از مرکز ملی اطلاعات زیست فناوری آمریکا (NCBI)، بخشی از همکاری بینالمللی پایگاه های توالی نوکلئوتیدی (INSDC). توالی‌های حاشیه نویسی شده تمام گونه‌های زیستی را که توسط محققان سراسر جهان ثبت شدهاند، ذخیره میکند. با ابزارهایی مانند BLAST برای همترازی توالی ها یکپارچه شده است.
✏️
تمرکز: توالی‌های پروتئینی و داده‌های عملکردی.
⏺
مرور: منبعی جامع که Swiss-Prot (داده‌های دستیاری شده با تفسیرهای کیفی) و TrEMBL (ترجمههای خودکار توالی های DNA) را ترکیب میکند.
شامل جزئیاتی درباره عملکرد، ساختار و تعاملات پروتئین هاست
.
✏️
تمرکز: ساختارهای سه بعدی مولکول‌های زیستی.
⏺
مرور: مخزن جهانی ساختارهای تجربی پروتئین ها، اسیدهای نوکلئیک و کمپلکس ها. ا
ز روشهای بلورشناسی اشعه ایکس، NMR یا میکروسکوپ الکترونی کرایو (cryo-EM) استفاده میکند. برای زیست شناسی ساختاری و طراحی دارو حیاتی است
.
✏️
تمرکز: داده‌های خام توالی یابی.
⏺
مرور: معادل اروپایی GenBank تحت نظر EMBL-EBI و بخشی از INSDC.
داده‌های خام توالی یابی (مثلاً از Illumina یا PacBio) و ژنوم های سر هم بندی شده را ذخیره میکند
. از تکرارپذیری پژوهش‌های ژنومیک پشتیبانی میکند.
✏️
تمرکز: داده‌های بیان ژن و اپیژنومیک.
⏺
مرور:
مخزن NCBI برای داده های پرحجم ( RNA-seq، ChIP-seq
). امکان تحلیل‌های فرا داده از تنظیم ژنها در بیماری‌ها و شرایط مختلف را فراهم میکند.
✏️
تمرکز: مسیرهای متابولیک، بیماری‌ها و تعاملات شیمیایی.
⏺
مرور:
داده‌های سیستم‌های زیستی مانند مسیرهای متابولیک/سیگنالینگ، ارتباط ژن-بیماری و اهداف دارویی را یکپارچه میکند
. منبعی کلیدی برای زیست‌شناسی سامانه‌ها و تحلیل شبکه‌ها.
✏️
تمرکز: حاشیه نویسی ژنومها و ژنومیک تطبیقی.
⏺
مرور: پلتفرم EMBL-EBI
برای ارائه ژنوم های حاشیه نویسی شده مهره داران و موجودات مدل.
شامل مرورگر‌های ژنومی، پیش‌بینی اثر واریانت‌ها و ابزارهای بررسی تکاملی است.
✏️
تمرکز: خانواده‌ها و دامنه‌های پروتئینی.
⏺
مرور:
پایگاه دادهای از دامنه
های پروتئینی هم ترازی شده و مدلهای مارکوف پنهان (HMM)
. به شناسایی نواحی عملکردی در پروتئین‌های ناشناخته کمک میکند.
✏️تمرکز: توالی‌های نوکلئوتیدی (DNA/RNA).
⏺مرور: یک پایگاه داده پایه ای از مرکز ملی اطلاعات زیست فناوری آمریکا (NCBI)، بخشی از همکاری بینالمللی پایگاه های توالی نوکلئوتیدی (INSDC). توالی‌های حاشیه نویسی شده تمام گونه‌های زیستی را که توسط محققان سراسر جهان ثبت شدهاند، ذخیره میکند. با ابزارهایی مانند BLAST برای همترازی توالی ها یکپارچه شده است.
✏️
تمرکز: توالی‌های پروتئینی و داده‌های عملکردی.
⏺
مرور: منبعی جامع که Swiss-Prot (داده‌های دستیاری شده با تفسیرهای کیفی) و TrEMBL (ترجمههای خودکار توالی های DNA) را ترکیب میکند.
شامل جزئیاتی درباره عملکرد، ساختار و تعاملات پروتئین هاست
.
✏️
تمرکز: ساختارهای سه بعدی مولکول‌های زیستی.
⏺
مرور: مخزن جهانی ساختارهای تجربی پروتئین ها، اسیدهای نوکلئیک و کمپلکس ها. ا
ز روشهای بلورشناسی اشعه ایکس، NMR یا میکروسکوپ الکترونی کرایو (cryo-EM) استفاده میکند. برای زیست شناسی ساختاری و طراحی دارو حیاتی است
.
✏️
تمرکز: داده‌های خام توالی یابی.
⏺
مرور: معادل اروپایی GenBank تحت نظر EMBL-EBI و بخشی از INSDC.
داده‌های خام توالی یابی (مثلاً از Illumina یا PacBio) و ژنوم های سر هم بندی شده را ذخیره میکند
. از تکرارپذیری پژوهش‌های ژنومیک پشتیبانی میکند.
✏️
تمرکز: داده‌های بیان ژن و اپیژنومیک.
⏺
مرور:
مخزن NCBI برای داده های پرحجم ( RNA-seq، ChIP-seq
). امکان تحلیل‌های فرا داده از تنظیم ژنها در بیماری‌ها و شرایط مختلف را فراهم میکند.
✏️
تمرکز: مسیرهای متابولیک، بیماری‌ها و تعاملات شیمیایی.
⏺
مرور:
داده‌های سیستم‌های زیستی مانند مسیرهای متابولیک/سیگنالینگ، ارتباط ژن-بیماری و اهداف دارویی را یکپارچه میکند
. منبعی کلیدی برای زیست‌شناسی سامانه‌ها و تحلیل شبکه‌ها.
✏️
تمرکز: حاشیه نویسی ژنومها و ژنومیک تطبیقی.
⏺
مرور: پلتفرم EMBL-EBI
برای ارائه ژنوم های حاشیه نویسی شده مهره داران و موجودات مدل.
شامل مرورگر‌های ژنومی، پیش‌بینی اثر واریانت‌ها و ابزارهای بررسی تکاملی است.
✏️
تمرکز: خانواده‌ها و دامنه‌های پروتئینی.
⏺
مرور:
پایگاه دادهای از دامنه
های پروتئینی هم ترازی شده و مدلهای مارکوف پنهان (HMM)
. به شناسایی نواحی عملکردی در پروتئین‌های ناشناخته کمک میکند.
