ИР
ИОГен РАН
Институт Общей Генетики им.Н.И. Вавилова Российской Академии наук-одно из старейших генетических учреждений в системе Академии наук.
Сайт: http://www.vigg.ru
Сайт: http://www.vigg.ru
关联群组
登录以解锁更多功能。
"ИОГен РАН" 群组最新帖子
07.02.202516:08
#семинары
Выкладываем запись семинара № 260 «Генетика и геномика» 12 декабря 2024 г. с докладом профессора М.С. Гельфанда «Системная биология немодельных организмов»
Выкладываем запись семинара № 260 «Генетика и геномика» 12 декабря 2024 г. с докладом профессора М.С. Гельфанда «Системная биология немодельных организмов»
28.01.202509:14
Одичавшие лошади о-ва Водный (фото: Игорь Шпиленок. http://shpilenok.livejournal.com/182339.html, CC BY-SA 3.0, https://commons.wikimedia.org/w/index.php?curid=27188228)
转发自:
Библиотека ИОГен
24.01.202509:25
#книжнаявыставка #личностьвгенетике
Уважаемые читатели!
Представляю вашему вниманию виртуальную книжную выставку «Генетик-эволюционист Феодосий Григорьевич Добржанский» к 125-летию со дня рождения ученого.
🧬 Ф.Г. Добржанский (1900-1975) – один из наиболее выдающихся генетиков-эволюционистов XX в., значение вклада которого в популяционную генетику и современную эволюционную теорию, а также влияние на современные исследования актуальных эволюционно-генетических проблем не раз подчеркивалось зарубежными и отечественными биологами и историками науки.
🧬 Ф.Г. Добржанский – один из основных создателей современной эволюционной теории. Его знаменитая монография «Генетика и происхождение видов», которая написана на основе джесуповских лекций, прочитанных Добржанским в 1936 г. в Колумбийском университете, и опубликованая в 1937 г., открыла ряд фундаментальных работ в этой области, каждая из которых как бы дополняла остальные, а все вместе взятые составили основу современных эволюционных представлений. При этом книга Добржанского послужила своеобразным катализатором и помогла тем ученым, эволюционные идеи которых еще только формировались.
🧬 Огромная заслуга Добржанского состоит в интеграции теоретических положений дарвинизма и данных генетики. Собрав эмпирические доказательства правильности предложенных ранее теоретических моделей действия генетических факторов и отбора в эволюции, он показал роль генетики в важнейших для эволюционной теории проблемах, в частности в явлении органического разнообразия и прерывистости.
🧬 В лаборатории Добржанского прошли подготовку многие ныне выдающиеся генетики со всех концов света, в том числе Б. Уоллес, Дж. Мур, Р. Левонтин, Ф. Айала. Сыграв большую роль в становлении генетики в Ленинградском университете в двадцатые годы, Добржанский имел учеников и среди советских генетиков: Ю.Я. Керкиса, Я.Я. Луса, Н. Н. Медведева, Ю.Л. Горощенко и других.
🧬 Будучи автором и соавтором целого ряда работ по генетике и эволюции человека, философским и гуманитарным аспектам эволюционной теории, Добржанский оказал значительное влияние на развитие соответствующих областей научного и философского знания, общечеловеческой культуры.
Несмотря на его преданность науке, она не была для него самоцелью. Он часто говорил, что знание биологии и эволюции необходимо для того, чтобы человек лучше понимал себя и свое место во Вселенной.
https://disk.yandex.ru/i/3RbpMZJrmpbdcQ
Уважаемые читатели!
Представляю вашему вниманию виртуальную книжную выставку «Генетик-эволюционист Феодосий Григорьевич Добржанский» к 125-летию со дня рождения ученого.
🧬 Ф.Г. Добржанский (1900-1975) – один из наиболее выдающихся генетиков-эволюционистов XX в., значение вклада которого в популяционную генетику и современную эволюционную теорию, а также влияние на современные исследования актуальных эволюционно-генетических проблем не раз подчеркивалось зарубежными и отечественными биологами и историками науки.
🧬 Ф.Г. Добржанский – один из основных создателей современной эволюционной теории. Его знаменитая монография «Генетика и происхождение видов», которая написана на основе джесуповских лекций, прочитанных Добржанским в 1936 г. в Колумбийском университете, и опубликованая в 1937 г., открыла ряд фундаментальных работ в этой области, каждая из которых как бы дополняла остальные, а все вместе взятые составили основу современных эволюционных представлений. При этом книга Добржанского послужила своеобразным катализатором и помогла тем ученым, эволюционные идеи которых еще только формировались.
🧬 Огромная заслуга Добржанского состоит в интеграции теоретических положений дарвинизма и данных генетики. Собрав эмпирические доказательства правильности предложенных ранее теоретических моделей действия генетических факторов и отбора в эволюции, он показал роль генетики в важнейших для эволюционной теории проблемах, в частности в явлении органического разнообразия и прерывистости.
🧬 В лаборатории Добржанского прошли подготовку многие ныне выдающиеся генетики со всех концов света, в том числе Б. Уоллес, Дж. Мур, Р. Левонтин, Ф. Айала. Сыграв большую роль в становлении генетики в Ленинградском университете в двадцатые годы, Добржанский имел учеников и среди советских генетиков: Ю.Я. Керкиса, Я.Я. Луса, Н. Н. Медведева, Ю.Л. Горощенко и других.
🧬 Будучи автором и соавтором целого ряда работ по генетике и эволюции человека, философским и гуманитарным аспектам эволюционной теории, Добржанский оказал значительное влияние на развитие соответствующих областей научного и философского знания, общечеловеческой культуры.
Несмотря на его преданность науке, она не была для него самоцелью. Он часто говорил, что знание биологии и эволюции необходимо для того, чтобы человек лучше понимал себя и свое место во Вселенной.
https://disk.yandex.ru/i/3RbpMZJrmpbdcQ
23.01.202509:34
#новостинауки
Опубликовано на PCR.NEWS https://pcr.news/novosti/transpozony-igrayut-rol-alternativnykh-promotorov-vo-vremya-rannego-embriogeneza-mlekopitayushchikh/
Транспозоны играют роль альтернативных промоторов во время раннего эмбриогенеза млекопитающих
Исследование, опубликованное в журнале Cell, выявило ключевую роль транспозонов в регуляции генов на ранних стадиях развития млекопитающих. Ученые разработали метод анализа инициации транскрипции и с его помощью показали, что транспозоны запускают транскрипцию генов, действуя как альтернативные промоторы. Анализ эмбрионов пяти видов млекопитающих выявил активную транскрипцию как эволюционно древних, так и молодых транспозонов, демонстрирующих общие и видоспецифичные паттерны.
Источник
Oomen, M. E et al. An atlas of transcription initiation reveals regulatory principles of gene and transposable element expression in early mammalian development. // Cell (2025), published online 20 January 2025. DOI: 10.1016/j.cell.2024.12.013
Опубликовано на PCR.NEWS https://pcr.news/novosti/transpozony-igrayut-rol-alternativnykh-promotorov-vo-vremya-rannego-embriogeneza-mlekopitayushchikh/
Транспозоны играют роль альтернативных промоторов во время раннего эмбриогенеза млекопитающих
Исследование, опубликованное в журнале Cell, выявило ключевую роль транспозонов в регуляции генов на ранних стадиях развития млекопитающих. Ученые разработали метод анализа инициации транскрипции и с его помощью показали, что транспозоны запускают транскрипцию генов, действуя как альтернативные промоторы. Анализ эмбрионов пяти видов млекопитающих выявил активную транскрипцию как эволюционно древних, так и молодых транспозонов, демонстрирующих общие и видоспецифичные паттерны.
Источник
Oomen, M. E et al. An atlas of transcription initiation reveals regulatory principles of gene and transposable element expression in early mammalian development. // Cell (2025), published online 20 January 2025. DOI: 10.1016/j.cell.2024.12.013
转发自:Библиотека ИОГен
20.01.202507:38
#личностьвгенетике
Уважаемые читатели!
20 января 2025 года исполняется 130 лет со дня рождения выдающегося генетика и знатока пшеницы Тениса Карловича Лепина. Этот учёный внёс значительный вклад в изучение изменчивости и наследования качественных и количественных характеристик пшеницы, одной из важнейших зерновых культур.
Будучи увлечённым наукой, трудолюбивый студент Лепин был замечен Ю. А. Филипченко, который вовлёк его в исследовательскую работу по изменчивости организмов. По предложению Филипченко Лепин был зачислен научным сотрудником в Бюро по евгенике и генетике. В 1934 году он защитил диссертацию и получил степень доктора наук за исследования в области генетики пшеницы.
С 1935 года Лепин начал тесное сотрудничество с Николаем Вавиловым, который привлекал его в помощь сотрудникам ВИРа, проводившим в Гандже широкомасштабные работы по гибридизации пшеницы. Теннис Карлович сосредоточился на изучении изменчивости пшеницы, исследуя влияние различных факторов на урожайность и качество зерна.
Исследовательская работа Лепина сочеталась с педагогической деятельностью на кафедре генетики Ленинградского университета. Владея в совершенстве вариационно-статистическим методом анализа в применении к явлениям изменчивости и наследственности, он передавал свои знания студентам кафедры генетики.
Лепин был одним из тех учёных, кто противостоял антинаучным подходам, таким как идеи Трофима Лысенко, отрицавшие классическую генетику. Его исследования способствовали сохранению научного подхода к селекции растений и пониманию наследственности.
📌 Авруцкая, Т. Б. Лепин Тенис Карлович / Т.Б. Авруцкая // Соратники Николая Ивановича Вавилова: исследователи генофонда растений / Федер. исслед. центр Всерос. ин-т генет. ресурсов растений им. Н.И. Вавилова; Дзюбенко Н.И. [и др.] (редкол.). — 2-е изд., знач. перераб. и доп. — Санкт-Петербург: ВИР, 2017. — С. 300-303. https://www.vir.nw.ru/wp-content/uploads/2022/11/Lepin-Tenis-Karlovich.pdf?ysclid=m5wdaxg5h1118770864
📌Любимова-Лепина, В. Ф. Памяти Тениса Карловича Лепина / В. Ф. Любимова-Лепина // Генетика. - 1995. - Т. 31, № 4. - С. 588–589. https://viewer.benran.ru/ru/ben01000389696?page=158&rotate=0&theme=white
📌 Лепин, Т.К. Действительные члены Академии наук за последние 80 лет (1846-1924) / Т. К. Лепин, Я. Я. Лус, Ю. А. Филипченко // Родословная гениальности: Из истории отечественной науки 1920-х гг. / Составление Е. В. Пчелова; Вступит. статья Е. В. Пчелова; Комментарии Е. В. Пчелова; Предисловиe Н. П. Бочкова. – М.: Старая Басманная, 2008. – 247-293. https://disk.yandex.ru/i/fJnb9w9Zjif-JA
📌 Филипченко Ю.А. К вопросу о наследовании цвета глаз и волос / Ю.А Филипченко, Т.К. Лепин // Известия Бюро по евгенике. – 1922. - № 1. – С. 39-63. https://disk.yandex.ru/i/WxTxqdSXx-vhgA
Уважаемые читатели!
20 января 2025 года исполняется 130 лет со дня рождения выдающегося генетика и знатока пшеницы Тениса Карловича Лепина. Этот учёный внёс значительный вклад в изучение изменчивости и наследования качественных и количественных характеристик пшеницы, одной из важнейших зерновых культур.
Будучи увлечённым наукой, трудолюбивый студент Лепин был замечен Ю. А. Филипченко, который вовлёк его в исследовательскую работу по изменчивости организмов. По предложению Филипченко Лепин был зачислен научным сотрудником в Бюро по евгенике и генетике. В 1934 году он защитил диссертацию и получил степень доктора наук за исследования в области генетики пшеницы.
С 1935 года Лепин начал тесное сотрудничество с Николаем Вавиловым, который привлекал его в помощь сотрудникам ВИРа, проводившим в Гандже широкомасштабные работы по гибридизации пшеницы. Теннис Карлович сосредоточился на изучении изменчивости пшеницы, исследуя влияние различных факторов на урожайность и качество зерна.
Исследовательская работа Лепина сочеталась с педагогической деятельностью на кафедре генетики Ленинградского университета. Владея в совершенстве вариационно-статистическим методом анализа в применении к явлениям изменчивости и наследственности, он передавал свои знания студентам кафедры генетики.
Лепин был одним из тех учёных, кто противостоял антинаучным подходам, таким как идеи Трофима Лысенко, отрицавшие классическую генетику. Его исследования способствовали сохранению научного подхода к селекции растений и пониманию наследственности.
📌 Авруцкая, Т. Б. Лепин Тенис Карлович / Т.Б. Авруцкая // Соратники Николая Ивановича Вавилова: исследователи генофонда растений / Федер. исслед. центр Всерос. ин-т генет. ресурсов растений им. Н.И. Вавилова; Дзюбенко Н.И. [и др.] (редкол.). — 2-е изд., знач. перераб. и доп. — Санкт-Петербург: ВИР, 2017. — С. 300-303. https://www.vir.nw.ru/wp-content/uploads/2022/11/Lepin-Tenis-Karlovich.pdf?ysclid=m5wdaxg5h1118770864
📌Любимова-Лепина, В. Ф. Памяти Тениса Карловича Лепина / В. Ф. Любимова-Лепина // Генетика. - 1995. - Т. 31, № 4. - С. 588–589. https://viewer.benran.ru/ru/ben01000389696?page=158&rotate=0&theme=white
📌 Лепин, Т.К. Действительные члены Академии наук за последние 80 лет (1846-1924) / Т. К. Лепин, Я. Я. Лус, Ю. А. Филипченко // Родословная гениальности: Из истории отечественной науки 1920-х гг. / Составление Е. В. Пчелова; Вступит. статья Е. В. Пчелова; Комментарии Е. В. Пчелова; Предисловиe Н. П. Бочкова. – М.: Старая Басманная, 2008. – 247-293. https://disk.yandex.ru/i/fJnb9w9Zjif-JA
📌 Филипченко Ю.А. К вопросу о наследовании цвета глаз и волос / Ю.А Филипченко, Т.К. Лепин // Известия Бюро по евгенике. – 1922. - № 1. – С. 39-63. https://disk.yandex.ru/i/WxTxqdSXx-vhgA
转发自:Библиотека ИОГен
20.01.202507:38
#публикациисотрудниковИОГен #молодойученый
Уважаемые читатели!
Вашему вниманию представляется подборка полнотекстовых изданий, содержащая уникальные сведения из истории Института генетики АН СССР, малоизвестные факты о пребывании Н.И. Вавилова в Англии в 1913–1914 годах и о его первом визите в США в 1921 году. Обнаруженные документальные материалы и фотографии из фондов Мемориального кабинета-музея академика Н.И. Вавилова, позволяют составить более точное впечатление об этих поездках, целях и результатах.
📖 Брошюры были выпущены ограниченным тиражом, и мы рады возможности, благодаря цифровым технологиям, представить результаты труда автора всем, кто интересуется историей генетики и научной деятельностью Н. И. Вавилова.
📎 Авруцкая, Т.Б. Прорыв в Америку. К 100-летию поездки Н. И. Вавилова в США, Канаду и Западную Европу. 1921-1922 гг. / Т. Б. Авруцкая; Российская академия наук, Институт общей генетики им. Н. И. Вавилова, Мемориальный кабинет-музей академика Н. И. Вавилова, Комиссия по сохранению и разработке научного наследия академика Н. И. Вавилова. — Москва: ИОГен РАН, 2021. — 23 с.: ил., портр., факс. — ISBN 978-5-904787-81-3. https://disk.yandex.ru/i/s1YwAd8V1NErRg
📎 Авруцкая, Т.Б. Оранжерейный корпус института генетики АН СССР: к 90-летию института / Т. Б. Авруцкая ; Российская академия наук, Институт общей генетики им. Н. И. Вавилова РАН [и др.]. — Москва : Акварель, 2021. — 19 с. : ил., портр. — ISBN 978-5-904787-82-0. https://disk.yandex.ru/i/oqpI-qlEFn67mg
📎 Авруцкая Т. Б. Н. И. Вавилов в Англии. 1913-1914 гг. Новые источники / Т. Б. Авруцкая ; Российская академия наук, Институт общей генетики им. Н. И. Вавилова РАН [и др.]. — Москва, 2021. — 20 с.: ил., портр. https://disk.yandex.ru/i/MtisrGI4I7ohDw
Уважаемые читатели!
Вашему вниманию представляется подборка полнотекстовых изданий, содержащая уникальные сведения из истории Института генетики АН СССР, малоизвестные факты о пребывании Н.И. Вавилова в Англии в 1913–1914 годах и о его первом визите в США в 1921 году. Обнаруженные документальные материалы и фотографии из фондов Мемориального кабинета-музея академика Н.И. Вавилова, позволяют составить более точное впечатление об этих поездках, целях и результатах.
📖 Брошюры были выпущены ограниченным тиражом, и мы рады возможности, благодаря цифровым технологиям, представить результаты труда автора всем, кто интересуется историей генетики и научной деятельностью Н. И. Вавилова.
📎 Авруцкая, Т.Б. Прорыв в Америку. К 100-летию поездки Н. И. Вавилова в США, Канаду и Западную Европу. 1921-1922 гг. / Т. Б. Авруцкая; Российская академия наук, Институт общей генетики им. Н. И. Вавилова, Мемориальный кабинет-музей академика Н. И. Вавилова, Комиссия по сохранению и разработке научного наследия академика Н. И. Вавилова. — Москва: ИОГен РАН, 2021. — 23 с.: ил., портр., факс. — ISBN 978-5-904787-81-3. https://disk.yandex.ru/i/s1YwAd8V1NErRg
📎 Авруцкая, Т.Б. Оранжерейный корпус института генетики АН СССР: к 90-летию института / Т. Б. Авруцкая ; Российская академия наук, Институт общей генетики им. Н. И. Вавилова РАН [и др.]. — Москва : Акварель, 2021. — 19 с. : ил., портр. — ISBN 978-5-904787-82-0. https://disk.yandex.ru/i/oqpI-qlEFn67mg
📎 Авруцкая Т. Б. Н. И. Вавилов в Англии. 1913-1914 гг. Новые источники / Т. Б. Авруцкая ; Российская академия наук, Институт общей генетики им. Н. И. Вавилова РАН [и др.]. — Москва, 2021. — 20 с.: ил., портр. https://disk.yandex.ru/i/MtisrGI4I7ohDw
转发自:Библиотека ИОГен
20.01.202507:37
#деньвкалендаре #мирнауки
Уважаемы читатели!
15 января была официально запущена Wikipedia. Этот день стал важным событием в истории интернета и образования, так как Википедия представила новую модель создания и распространения знаний.
Wikipedia была основана Джимми Уэйлсом и Ларри Сэнгером как дополнение к проекту Nupedia, который использовал традиционный подход к написанию статей, требующий рецензирования экспертами. В отличие от Nupedia, Wikipedia использует технологию "вики", позволяющую любому пользователю редактировать статьи. Это сделало её более динамичной и доступной платформой для обмена знаниями.
Первоначально Википедия была запущена как англоязычный проект, но быстро расширилась на множество языков. На данный момент она содержит более 60 миллионов статей на различных языках, что делает её одной из крупнейших энциклопедий в мире.
Wikipedia имеет значительную научную ценность благодаря своей открытой модели, которая позволяет пользователям вносить изменения и добавлять новые данные. Это создает возможность для коллективного редактирования и улучшения информации. Однако, из-за открытости платформы, существует риск появления недостоверной информации. Тем не менее, исследования показывают, что вандализм обычно быстро устраняется, и качество статей довольно высоко.
Существуют различные альтернативы Wikipedia для поиска информации:
📌 Британника: традиционная энциклопедия с рецензируемыми статьями.
📌 Stanford Encyclopedia of Philosophy: ресурс для глубокого изучения философских тем.
📌 Scholarpedia: вики-энциклопедия, где статьи пишутся и рецензируются учеными.
📌 Руви́ки — российская онлайн-энциклопедия, запущенная в режиме бета-тестирования 24 июня 2023 года: статьи проекта были скопированы из русской Wikipedia, некоторые из них были изменены для соответствия требованиям российской цензуры. 15 января 2024 года портал был официально открыт, на момент запуска функционировали разделы на 12 языках России.
Каждый из этих ресурсов имеет свои преимущества и недостатки, но все они служат дополнением к информации, представленной в Wikipedia.
Таким образом, 15 января является не только днем рождения Wikipedia, но и символом новой эры в доступе к знаниям и образованию.
Уважаемы читатели!
15 января была официально запущена Wikipedia. Этот день стал важным событием в истории интернета и образования, так как Википедия представила новую модель создания и распространения знаний.
Wikipedia была основана Джимми Уэйлсом и Ларри Сэнгером как дополнение к проекту Nupedia, который использовал традиционный подход к написанию статей, требующий рецензирования экспертами. В отличие от Nupedia, Wikipedia использует технологию "вики", позволяющую любому пользователю редактировать статьи. Это сделало её более динамичной и доступной платформой для обмена знаниями.
Первоначально Википедия была запущена как англоязычный проект, но быстро расширилась на множество языков. На данный момент она содержит более 60 миллионов статей на различных языках, что делает её одной из крупнейших энциклопедий в мире.
Wikipedia имеет значительную научную ценность благодаря своей открытой модели, которая позволяет пользователям вносить изменения и добавлять новые данные. Это создает возможность для коллективного редактирования и улучшения информации. Однако, из-за открытости платформы, существует риск появления недостоверной информации. Тем не менее, исследования показывают, что вандализм обычно быстро устраняется, и качество статей довольно высоко.
Существуют различные альтернативы Wikipedia для поиска информации:
📌 Британника: традиционная энциклопедия с рецензируемыми статьями.
📌 Stanford Encyclopedia of Philosophy: ресурс для глубокого изучения философских тем.
📌 Scholarpedia: вики-энциклопедия, где статьи пишутся и рецензируются учеными.
📌 Руви́ки — российская онлайн-энциклопедия, запущенная в режиме бета-тестирования 24 июня 2023 года: статьи проекта были скопированы из русской Wikipedia, некоторые из них были изменены для соответствия требованиям российской цензуры. 15 января 2024 года портал был официально открыт, на момент запуска функционировали разделы на 12 языках России.
Каждый из этих ресурсов имеет свои преимущества и недостатки, но все они служат дополнением к информации, представленной в Wikipedia.
Таким образом, 15 января является не только днем рождения Wikipedia, но и символом новой эры в доступе к знаниям и образованию.
17.01.202520:39
#семинары Семинар в ИОГен РАН (29 января 2025 г. 15-00)
Нуклеопротеидный мир: возникновение жизни на основе гипотезы прогенов
А.Д.Альтштейн
Аннотация
Прогены (progenes) – это аминоацилированные неслучайной аминокислотой
олигонуклеотиды с общей формулой 5'NpNpNp~pN~aa (N – нуклеозид, p – фосфат,
аа – аминокислота, ~ - макроэргическая связь). В докладе будет обсуждаться
вопрос о механизме образования прогенов, который позволяет решить проблему
возникновения генетического кода,
формирования первой бимолекулярной нуклеопротеидной генетической системы на
основе прогенов. Эта система, репродуцирующаяся путем репликации, транскрипции и трансляции, может рассматриваться как
первый живой организм (Protoviroidum primum)
– прародитель современного живого мира
на Земле.
Гипотеза прогенов – это
альтернатива общепринятой гипотезы «РНК-мира».
Aльтштейн
А.Д.- Происхождение
генетической системы: гипотеза прогенов. Мол. Биол., 1987, 21, 309-322.
Altstein AD - The progene hypothesis: the nucleoprotein world
and how life began. Biology Direct, 2015, 10:67
Нуклеопротеидный мир: возникновение жизни на основе гипотезы прогенов
А.Д.Альтштейн
Аннотация
Прогены (progenes) – это аминоацилированные неслучайной аминокислотой
олигонуклеотиды с общей формулой 5'NpNpNp~pN~aa (N – нуклеозид, p – фосфат,
аа – аминокислота, ~ - макроэргическая связь). В докладе будет обсуждаться
вопрос о механизме образования прогенов, который позволяет решить проблему
возникновения генетического кода,
формирования первой бимолекулярной нуклеопротеидной генетической системы на
основе прогенов. Эта система, репродуцирующаяся путем репликации, транскрипции и трансляции, может рассматриваться как
первый живой организм (Protoviroidum primum)
– прародитель современного живого мира
на Земле.
Гипотеза прогенов – это
альтернатива общепринятой гипотезы «РНК-мира».
Aльтштейн
А.Д.- Происхождение
генетической системы: гипотеза прогенов. Мол. Биол., 1987, 21, 309-322.
Altstein AD - The progene hypothesis: the nucleoprotein world
and how life began. Biology Direct, 2015, 10:67
17.01.202520:26
17.01.202507:34
17.01.202507:33
17.01.202507:29
#наукаИОГен Выявленные пептиды относятся к 9 семействам. В геноме пырея обнаружено 39 генов, которые кодируют предшественники пептидов дефензинов. Это универсальные защитные пептиды, найденные у всех многоклеточных. Считается, что дефензины растений участвуют в защите от грибных и бактериальных патогенов, используя разные механизмы – нарушение проницаемости мембран, ингибирование ионных каналов и подавление активности ферментов. 10 генов пырея кодируют предшественники пептидов снакинов, специфичных для растений цистеин-богатых АМП. Снакины эффективно подавляют рост бактерий и грибов, а также участвуют в различных физиологических процессах. Также, у пырея обнаружен один ген предшественника гевеиноподобного пептида, который по аминокислотной последовательности совпадает с таковым пшеницы T. kiharae, обладающим антифугальными и антибактериальными свойствами. А также один ген предшественника тионина, сходного с пептидом пшеницы T. aestivum. Самым многочисленным семейством генов АМП у пырея являются неспецифические липид-переносящие белки (LTP), всего было обнаружено 78 генов. Как и тионины, LTPs выявлены только у растений. АМП помимо защитных свойств выполняют и другие функции в растениях. Более того, было выявлено 10 генов предшественников пептидов RALF, выполняющих регуляторную функцию при PTI; три гена предшественников пептидов MEG; а также три гена предшественников пептидов Ole e 1, чья роль в защите изучена слабо. Обнаружено также новое семейство генов пептидов CRP с ранее неизвестным 6-Цис-мотивом, функции которых еще предстоит изучить.
Поиск сходных последовательностей с помощью программ BLAST показал, что пептиды пырея обладают максимальным сходством с пептидами растений семейства мятликовые, прежде всего относящихся к родам Triticum (пшеница) и Aegilops (эгилопс, ближайший родственник пшеницы).
Авторы изучили распределение генов разных семейств пептидов по хромосомам пырея и картировали их; обнаружилось, что для многих хромосом генами пептидов обогащены области, примыкающие к теломерным районам. Иногда гены пептидов одного семейства образуют кластеры, что указывает на возможное их образование в результате тандемных дупликаций.
Таким образом, авторам удалось найти in silico в геноме пырея комплекс генов защитных пептидов, которые обеспечивают его устойчивость к патогенам. Это, с одной стороны, интересно для характеристики молекулярных компонентов иммунной системы пырея, а с другой стороны, необходимо для научно обоснованного использования Th. еlongatum в качестве донора устойчивости пшеницы. Что актуально, так как ежегодно около 20% урожая пшеницы теряется из-за болезней, плюс случаются засухи, засоленность почвы и загрязнение тяжелыми металлами.
Дальнейшие исследования биологической активности обнаруженных пептидов с использованием трансгенных технологий и тестирования in vitro позволят понять их роль в защите от стресса, а также в других физиологических процессах.
Источник:
Слезина М.П., Истомина Е.А., Шиян А.Н., Одинцова Т.И. ГЕНЫ ЦИСТЕИН-БОГАТЫХ ПЕПТИДОВ ПЫРЕЯ Thinopyrum elongatum // Генетика. – 2024. – Т. 60. – № 10. – С. 56–70. DOI: 10.31857/S0016675824100055
Поиск сходных последовательностей с помощью программ BLAST показал, что пептиды пырея обладают максимальным сходством с пептидами растений семейства мятликовые, прежде всего относящихся к родам Triticum (пшеница) и Aegilops (эгилопс, ближайший родственник пшеницы).
Авторы изучили распределение генов разных семейств пептидов по хромосомам пырея и картировали их; обнаружилось, что для многих хромосом генами пептидов обогащены области, примыкающие к теломерным районам. Иногда гены пептидов одного семейства образуют кластеры, что указывает на возможное их образование в результате тандемных дупликаций.
Таким образом, авторам удалось найти in silico в геноме пырея комплекс генов защитных пептидов, которые обеспечивают его устойчивость к патогенам. Это, с одной стороны, интересно для характеристики молекулярных компонентов иммунной системы пырея, а с другой стороны, необходимо для научно обоснованного использования Th. еlongatum в качестве донора устойчивости пшеницы. Что актуально, так как ежегодно около 20% урожая пшеницы теряется из-за болезней, плюс случаются засухи, засоленность почвы и загрязнение тяжелыми металлами.
Дальнейшие исследования биологической активности обнаруженных пептидов с использованием трансгенных технологий и тестирования in vitro позволят понять их роль в защите от стресса, а также в других физиологических процессах.
Источник:
Слезина М.П., Истомина Е.А., Шиян А.Н., Одинцова Т.И. ГЕНЫ ЦИСТЕИН-БОГАТЫХ ПЕПТИДОВ ПЫРЕЯ Thinopyrum elongatum // Генетика. – 2024. – Т. 60. – № 10. – С. 56–70. DOI: 10.31857/S0016675824100055
17.01.202507:29
#наукаИОГен
В геноме пырея путем биоинформатического анализа нашли 154 гена антимикробных пептидов
Исследователи из лаборатории молекулярно-генетических основ иммунитета растений Института общей генетики РАН обнаружили и описали гены антимикробных и сигнальных пептидов у пырея удлиненного (Thinopyrum elongatum). Это дикорастущий злак семейства мятликовые, который отличается высокой устойчивостью к разнообразным патогенам, а также низким температурам, засоленности почвы, засухе. Устойчивость пырея к биотическим и абиотическим факторам среды делает его уникальным объектом в качестве донора устойчивости с использованием классических методов при селекции пшеницы. Гены антимикробных пептидов (АМП) у пырея удлиненного до сих пор не были изучены. В данной работе эта задача была решена in silico, путем биоинформатического анализа. Результаты исследования опубликованы в журнале Генетика и в его англоязычной версии Russian Journal of Genetics.
Иммунная система растений работает на двух уровнях. Первый, базовый уровень обеспечивает система защиты от неспециализированных патогенов (PTI), она активируется при узнавании рецепторами растительной клетки эволюционно консервативных структур патогена. Второй уровень – защита от специализированных патогенов, ее обеспечивает система (ETI) в ответ на узнавание факторов вирулентности патогена. Но и та, и другая система при встрече с патогеном приводит к сходным защитным процессам, одним из которых является синтез АМП. Антимикробные пептиды непосредственно взаимодействуют с патогенами и подавляют их рост. Состав АМП разнообразен в пределах одного вида растений, и механизмы их действия также разнообразны. Помимо АМП к группе защитных пептидов относятся регуляторные пептиды – они участвуют в сигнальных путях, координируя взаимодействия растений с патогенными и непатогенными микроорганизмами, а также стрессовыми факторами среды.
Наиболее многочисленную группу АМП составляют пептиды, обогащенные остатками аминокислоты цистеина (цистеин-богатые пептиды, ЦБП). Их объединяет общее строение: белок-предшественник, кодируемый геном, состоит из сигнального пептида и зрелого пептида, который обогащен остатками цистеина (4−16) и обладает антимикробной активностью.
Методы полногеномного секвенирования и биоинформатики открывают возможности поиска генов ЦБП in silico в геномных и транскриптомных данных. Для анализа ученые использовали последнюю версию секвенированного генома Th. elongatum D-3458 (GenBank GCA_011799875.1). Поиск генов АМП и регуляторных пептидов проводили с использованием собственного разработанного алгоритма поиска по цистеиновым мотивам. В результате в геноме пырея нашли 154 гена АМП и регуляторных пептидов, связанных с защитными функциями. В ряде генов были обнаружены интроны. Также была определена структура предшественников пептидов и предсказаны антимикробные свойства пептидов.
В геноме пырея путем биоинформатического анализа нашли 154 гена антимикробных пептидов
Исследователи из лаборатории молекулярно-генетических основ иммунитета растений Института общей генетики РАН обнаружили и описали гены антимикробных и сигнальных пептидов у пырея удлиненного (Thinopyrum elongatum). Это дикорастущий злак семейства мятликовые, который отличается высокой устойчивостью к разнообразным патогенам, а также низким температурам, засоленности почвы, засухе. Устойчивость пырея к биотическим и абиотическим факторам среды делает его уникальным объектом в качестве донора устойчивости с использованием классических методов при селекции пшеницы. Гены антимикробных пептидов (АМП) у пырея удлиненного до сих пор не были изучены. В данной работе эта задача была решена in silico, путем биоинформатического анализа. Результаты исследования опубликованы в журнале Генетика и в его англоязычной версии Russian Journal of Genetics.
Иммунная система растений работает на двух уровнях. Первый, базовый уровень обеспечивает система защиты от неспециализированных патогенов (PTI), она активируется при узнавании рецепторами растительной клетки эволюционно консервативных структур патогена. Второй уровень – защита от специализированных патогенов, ее обеспечивает система (ETI) в ответ на узнавание факторов вирулентности патогена. Но и та, и другая система при встрече с патогеном приводит к сходным защитным процессам, одним из которых является синтез АМП. Антимикробные пептиды непосредственно взаимодействуют с патогенами и подавляют их рост. Состав АМП разнообразен в пределах одного вида растений, и механизмы их действия также разнообразны. Помимо АМП к группе защитных пептидов относятся регуляторные пептиды – они участвуют в сигнальных путях, координируя взаимодействия растений с патогенными и непатогенными микроорганизмами, а также стрессовыми факторами среды.
Наиболее многочисленную группу АМП составляют пептиды, обогащенные остатками аминокислоты цистеина (цистеин-богатые пептиды, ЦБП). Их объединяет общее строение: белок-предшественник, кодируемый геном, состоит из сигнального пептида и зрелого пептида, который обогащен остатками цистеина (4−16) и обладает антимикробной активностью.
Методы полногеномного секвенирования и биоинформатики открывают возможности поиска генов ЦБП in silico в геномных и транскриптомных данных. Для анализа ученые использовали последнюю версию секвенированного генома Th. elongatum D-3458 (GenBank GCA_011799875.1). Поиск генов АМП и регуляторных пептидов проводили с использованием собственного разработанного алгоритма поиска по цистеиновым мотивам. В результате в геноме пырея нашли 154 гена АМП и регуляторных пептидов, связанных с защитными функциями. В ряде генов были обнаружены интроны. Также была определена структура предшественников пептидов и предсказаны антимикробные свойства пептидов.
转发自:Библиотека ИОГен
16.01.202520:54
#деньвкалендаре #мирнауки
Уважаемы читатели!
15 января была официально запущена Wikipedia. Этот день стал важным событием в истории интернета и образования, так как Википедия представила новую модель создания и распространения знаний.
Wikipedia была основана Джимми Уэйлсом и Ларри Сэнгером как дополнение к проекту Nupedia, который использовал традиционный подход к написанию статей, требующий рецензирования экспертами. В отличие от Nupedia, Wikipedia использует технологию "вики", позволяющую любому пользователю редактировать статьи. Это сделало её более динамичной и доступной платформой для обмена знаниями.
Первоначально Википедия была запущена как англоязычный проект, но быстро расширилась на множество языков. На данный момент она содержит более 60 миллионов статей на различных языках, что делает её одной из крупнейших энциклопедий в мире.
Wikipedia имеет значительную научную ценность благодаря своей открытой модели, которая позволяет пользователям вносить изменения и добавлять новые данные. Это создает возможность для коллективного редактирования и улучшения информации. Однако, из-за открытости платформы, существует риск появления недостоверной информации. Тем не менее, исследования показывают, что вандализм обычно быстро устраняется, и качество статей довольно высоко.
Существуют различные альтернативы Wikipedia для поиска информации:
📌 Британника: традиционная энциклопедия с рецензируемыми статьями.
📌 Stanford Encyclopedia of Philosophy: ресурс для глубокого изучения философских тем.
📌 Scholarpedia: вики-энциклопедия, где статьи пишутся и рецензируются учеными.
📌 Руви́ки — российская онлайн-энциклопедия, запущенная в режиме бета-тестирования 24 июня 2023 года: статьи проекта были скопированы из русской Wikipedia, некоторые из них были изменены для соответствия требованиям российской цензуры. 15 января 2024 года портал был официально открыт, на момент запуска функционировали разделы на 12 языках России.
Каждый из этих ресурсов имеет свои преимущества и недостатки, но все они служат дополнением к информации, представленной в Wikipedia.
Таким образом, 15 января является не только днем рождения Wikipedia, но и символом новой эры в доступе к знаниям и образованию.
Уважаемы читатели!
15 января была официально запущена Wikipedia. Этот день стал важным событием в истории интернета и образования, так как Википедия представила новую модель создания и распространения знаний.
Wikipedia была основана Джимми Уэйлсом и Ларри Сэнгером как дополнение к проекту Nupedia, который использовал традиционный подход к написанию статей, требующий рецензирования экспертами. В отличие от Nupedia, Wikipedia использует технологию "вики", позволяющую любому пользователю редактировать статьи. Это сделало её более динамичной и доступной платформой для обмена знаниями.
Первоначально Википедия была запущена как англоязычный проект, но быстро расширилась на множество языков. На данный момент она содержит более 60 миллионов статей на различных языках, что делает её одной из крупнейших энциклопедий в мире.
Wikipedia имеет значительную научную ценность благодаря своей открытой модели, которая позволяет пользователям вносить изменения и добавлять новые данные. Это создает возможность для коллективного редактирования и улучшения информации. Однако, из-за открытости платформы, существует риск появления недостоверной информации. Тем не менее, исследования показывают, что вандализм обычно быстро устраняется, и качество статей довольно высоко.
Существуют различные альтернативы Wikipedia для поиска информации:
📌 Британника: традиционная энциклопедия с рецензируемыми статьями.
📌 Stanford Encyclopedia of Philosophy: ресурс для глубокого изучения философских тем.
📌 Scholarpedia: вики-энциклопедия, где статьи пишутся и рецензируются учеными.
📌 Руви́ки — российская онлайн-энциклопедия, запущенная в режиме бета-тестирования 24 июня 2023 года: статьи проекта были скопированы из русской Wikipedia, некоторые из них были изменены для соответствия требованиям российской цензуры. 15 января 2024 года портал был официально открыт, на момент запуска функционировали разделы на 12 языках России.
Каждый из этих ресурсов имеет свои преимущества и недостатки, но все они служат дополнением к информации, представленной в Wikipedia.
Таким образом, 15 января является не только днем рождения Wikipedia, но и символом новой эры в доступе к знаниям и образованию.
16.01.202507:10
#наукаИОГен Опубликовано на сайте PCR.NEWS https://pcr.news/novosti/aktivnost-regulyatornykh-elementov-v-genome-cheloveka-nauchilis-tochno-predskazyvat-po-ikh-nukleotid/