30 июня 1954 года Монсон подписал указ о аресте всех членов Гватемальской партии труда, здание Центрального комитета партии было занято солдатами. В этот же день было объявлено о роспуске Всеобщей конфедерации труда.
Армас развернул в стране массовые репрессии, было объявлено об аресте четырёх тысяч человек, подозревавшихся в «коммунистической деятельности». Под этим предлогом начались убийства активистов профсоюзного движения и других общественных организаций.
17 июля 1954 года Всемирная федерация профсоюзов заявила протест в связи с расстрелом 45 профсоюзных руководителей (среди которых были все организаторы забастовки на банановых плантациях компании «Юнайтед фрут»). Федерация женщин Бразилии заявила протест генеральному секретарю ООН после того, как была убита секретарь союза женщин Гватемалы Аида Годой Деверас.
19 июля 1954 года в стране был образован «Национальный комитет защиты от коммунизма» (Comite de Defensa Nacional contra el Comunismo), наделённый широкими правами, а 24 августа 1954 года — принят закон о борьбе с коммунизмом (Ley Preventiva Penal Contra el Comunismo).
Комитет проводил заседания за закрытыми дверьми и был вправе объявить любого гражданина коммунистом без права обжалования. Люди, взятые комитетом на учёт, могли произвольно подвергаться арестам на срок до шести месяцев, им запрещалось иметь радиоприёмники и работать в государственных, муниципальных и общественных учреждениях. В последующие четыре месяца власти зарегистрировали 72 тысячи человек, которые были объявлены коммунистами или симпатизирующими им. Чиновник комитета заявил о намерении зарегистрировать около 200 тыс. чел.
В результате, уже к 19 июля 1954 года более 900 сторонников Арбенса (в том числе, члены правительства) были вынуждены укрыться на территории девяти посольств и дипломатических представительств, размещенных в столице Гватемалы[55]. В дальнейшем, в течение первых трёх месяцев правления Армаса, дипломатические представительства «представляли собой переполненный сумасшедший дом», они были заполнены желающими выехать из страны и получить политическое убежище[56]. Эмиграция не прекращалась и в последующем, кроме того, многие сторонники Арбенса покидали страну, пересекая границы с сопредельными государствами.
Сторонники Х. Арбенса в правительстве, военнослужащие и полицейские, принимавшие участие в боевых действиях против армии Армаса, были уволены со службы, многие были репрессированы. Так, 9 октября 1954 года правительство Армаса потребовало от пяти латиноамериканских государств выдать в порядке экстрадиции Х. Арбенса и 15 членов его правительства; в июне 1955 года по решению суда были расстреляны два полицейских.
