| آکادمی زیست اومیکس |
🔺آکادمی زیست اومیکس شبکه نخبگان ایران
🧬مرجع فعالیت‌های آموزشی، پژوهشی و استارت‌آپی در حوزه اومیکس
💬 ارتباط با ادمین
| @IEN_Admin |
وابسته به شبکه نخبگان ایران
| @IranElitesNet |
🧬مرجع فعالیت‌های آموزشی، پژوهشی و استارت‌آپی در حوزه اومیکس
💬 ارتباط با ادمین
| @IEN_Admin |
وابسته به شبکه نخبگان ایران
| @IranElitesNet |
Рэйтынг TGlist
0
0
ТыпПублічны
Вертыфікацыя
Не вертыфікаваныНадзейнасць
Не надзейныРазмяшчэнне
МоваІншая
Дата стварэння каналаКвіт 01, 2025
Дадана ў TGlist
Квіт 13, 2025Рэкорды
28.04.202523:59
332Падпісчыкаў26.04.202523:59
200Індэкс цытавання28.04.202520:06
0Ахоп 1 паста28.04.202520:06
0Ахоп рэкламнага паста28.04.202520:06
0.00%ER13.04.202523:59
0.00%ERRПераслаў з:
| انجمن علمی زیستشناسی |
26.04.202512:40
🐍Python for Biologists | پایتون برای زیست شناسان
👨💻الگوریتم‌های هوشمند، دریچه‌ای به درک ژرف‌تر ساختارهای زیستی
👤کیانوش نقیب زاده
⏺پژوهشگر مقطع دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه Helsinki فنلاند
⏺پژوهشگر آنالیز دیتا Omics در دانشگاه Manitoba کانادا
📝سرفصل‌ها:
⏺آشنایی با پایتون و IDE ها | نصب پایتون و VS Code
⏺چرا پایتون؟ | کاربرد آن در زیستشناسی
⏺متغیرها و انواع آن
توابع شرطی if و else و حلقه‌ها (for, while)
⏺تابع نویسی | همراه با پروژه اختصاصی برای هر فرد
⏺آشنایی با پکیج Pandas, Numpy و Biopython برای زیست شناسان
⏺نوشتن تابعی برای خواندن فایل FASTA و محاسبه GC content آن و نمایش دادن آن
⏺خواندن فایل های CSV و xlsx - و Visualize کردن دیتا (به کمک پکیج های matplotlib و seaborn)
⏺معرفی ماشین لرنینگ و کاربرد آن در بیوانفورماتیک
📆زمان شروع جلسات: از شنبه ۱۳ اردیبهشت ماه
💻در ۶ جلسه به صورت مجازی در بستر اسکای‌روم
🎖همراه با اعطای سرتیفیکیت انگلیسی از شبکه نخبگان ایران
🤝امکان همکاری با مدرس در آینده برای افراد برتر
💰هزینه سرمایه‌گذاری علمی:
۳۹۰ هزار تومان برای دانشجویان و ۵۹۰ هزار تومان برای سایر علاقه‌مندان
🔗لینک ثبت‌نام
ارتباط با ادمین:👇
🆔 @Biology_network_admin
🧬در کانال‌های انجمن علمی زیست شناسی و آکادمی زیست اومیکس با ما همراه باشید…
| @Biology_Network |
| @BioOmics_Academy |
👨💻الگوریتم‌های هوشمند، دریچه‌ای به درک ژرف‌تر ساختارهای زیستی
👤کیانوش نقیب زاده
⏺پژوهشگر مقطع دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه Helsinki فنلاند
⏺پژوهشگر آنالیز دیتا Omics در دانشگاه Manitoba کانادا
📝سرفصل‌ها:
⏺آشنایی با پایتون و IDE ها | نصب پایتون و VS Code
⏺چرا پایتون؟ | کاربرد آن در زیستشناسی
⏺متغیرها و انواع آن
توابع شرطی if و else و حلقه‌ها (for, while)
⏺تابع نویسی | همراه با پروژه اختصاصی برای هر فرد
⏺آشنایی با پکیج Pandas, Numpy و Biopython برای زیست شناسان
⏺نوشتن تابعی برای خواندن فایل FASTA و محاسبه GC content آن و نمایش دادن آن
⏺خواندن فایل های CSV و xlsx - و Visualize کردن دیتا (به کمک پکیج های matplotlib و seaborn)
⏺معرفی ماشین لرنینگ و کاربرد آن در بیوانفورماتیک
📆زمان شروع جلسات: از شنبه ۱۳ اردیبهشت ماه
💻در ۶ جلسه به صورت مجازی در بستر اسکای‌روم
🎖همراه با اعطای سرتیفیکیت انگلیسی از شبکه نخبگان ایران
🤝امکان همکاری با مدرس در آینده برای افراد برتر
💰هزینه سرمایه‌گذاری علمی:
۳۹۰ هزار تومان برای دانشجویان و ۵۹۰ هزار تومان برای سایر علاقه‌مندان
🔗لینک ثبت‌نام
ارتباط با ادمین:👇
🆔 @Biology_network_admin
🧬در کانال‌های انجمن علمی زیست شناسی و آکادمی زیست اومیکس با ما همراه باشید…
| @Biology_Network |
| @BioOmics_Academy |
20.04.202512:22
🧠هوش مصنوعی می‌تواند سم مارها را بی‌خطر کند🐍
💊دانشمندان با استفاده از هوش مصنوعی موفق شدهاند پروتئین‌هایی طراحی کنند که قادرند سموم تولید شده توسط مارهای سمی مانند کبرا را خنثی کنند. این یک پیشرفت مهم در حوزه پزشکی است و می‌تواند در آینده به عنوان یک درمان مؤثر برای نیش مارها مورد استفاده قرار گیرد. در آزمایش‌های انجام شده، این پروتئین‌های طراحی شده توسط هوش مصنوعی توانستند موش‌هایی را که دوز کشنده‌ای از سم دریافت کرده بودند، نجات دهند. محققان در ۱۵ ژانویه در نشریه نیچر گزارش کردند.
مایکل هاست، پژوهشگر حوزه آنتی‌بادی در دانشگاه فنی براونشوایگ آلمان ، درباره این دستاورد گفت: (این پروتئین‌ها واقعاً مؤثر هستند. موش‌ها زنده ماندند و این دقیقاً همان نتیجه‌ای است که همه ما به دنبال آن هستیم).
🧪تولیدکنندگان فعلی پادزهر (آنتی‌ونوم) سم مارها، برای به دست آوردن سم، مستقیماً از خود مارها سم استخراج می‌کنند. این فرآیند بسیار خطرناک است و جنکینز آن را مانند «دست زدن به یک نارنجک زنده» توصیف میکند. در این روش، مقدار کمی از سم به حیوانات بزرگی مانند اسب تزریق می‌شود و سپس آنتی‌بادی‌های تولید شده توسط این حیوانات استخراج می‌شود.
🔬جنکینز و بیکر با همکاری یکدیگر از یک مدل هوش مصنوعی به نام RFdiffusion استفاده کردند تا پروتئین‌های سفارشی طراحی کنند. این ابزار شبیه به هوش‌های مصنوعی است که تصاویر تولید می‌کنند، اما به جای ایجاد تصویر، می‌تواند ساختارهای پروتئینی طراحی کند که دقیقاً با مولکول‌های هدف (مانند سموم مارها) مطابقت دارند.
بیکر و جنکینز از این هوش مصنوعی خواستند تا پروتئین‌هایی طراحی کند که به سموم مارها بچسبند. سپس این پروتئین‌ها در آزمایشگاه ساخته شدند. این پروتئین‌ها مانند یک کلاه مغناطیسی عمل می‌کنند که نوک یک کلید را می‌پوشاند و مانع از باز کردن قفل می‌شود. به همین ترتیب، پروتئین‌های طراحی شده توسط هوش مصنوعی از اتصال سموم به سلول‌های بدن جلوگیری کرده و آن‌ها را بی‌خطر می‌کنند.
☠️یکی از خطرناک‌ترین اجزای سم مارها، سموم سه‌انگشتی (3FTx) هستند که می‌توانند باعث آسیب‌های بافتی شدید و اختلال در عملکرد سیستم عصبی شوند. در حال حاضر، تنها درمان موجود برای نیش مارها، استفاده از آنتی‌بادی‌های پلی‌کلونال است که از حیوانات ایمن‌شده استخراج می‌شوند. این روش نه تنها هزینه‌بر است، بلکه کارایی محدودی در خنثی‌کردن سموم سه‌انگشتی دارد.
در این مطالعه، محققان از روشهای یادگیری عمیق و هوش مصنوعی برای طراحی پروتئین‌هایی استفاده کردند که به سموم عصبی و سیتوتوکسین‌های خانواده 3FTx متصل می‌شوند. این پروتئین‌ها با دقت بالا طراحی شدند و در آزمایش‌های اولیه، توانستند سموم را به طور مؤثر خنثی کنند و موش‌ها را از مرگ نجات دهند. این پروتئین‌ها نه تنها پایدار و قوی هستند، بلکه به راحتی قابل تولید نیز می‌باشند. این دستاورد می‌تواند پایه‌ای برای تولید نسل جدیدی از پادزهرها باشد که ایمن‌تر، ارزان‌تر و در دسترس‌تر هستند.
✔️منبع #خبر
🧬در کانال آکادمی زیست اومیکس با ما همراه باشید…
| @BioOmics_Academy |
💊دانشمندان با استفاده از هوش مصنوعی موفق شدهاند پروتئین‌هایی طراحی کنند که قادرند سموم تولید شده توسط مارهای سمی مانند کبرا را خنثی کنند. این یک پیشرفت مهم در حوزه پزشکی است و می‌تواند در آینده به عنوان یک درمان مؤثر برای نیش مارها مورد استفاده قرار گیرد. در آزمایش‌های انجام شده، این پروتئین‌های طراحی شده توسط هوش مصنوعی توانستند موش‌هایی را که دوز کشنده‌ای از سم دریافت کرده بودند، نجات دهند. محققان در ۱۵ ژانویه در نشریه نیچر گزارش کردند.
مایکل هاست، پژوهشگر حوزه آنتی‌بادی در دانشگاه فنی براونشوایگ آلمان ، درباره این دستاورد گفت: (این پروتئین‌ها واقعاً مؤثر هستند. موش‌ها زنده ماندند و این دقیقاً همان نتیجه‌ای است که همه ما به دنبال آن هستیم).
🧪تولیدکنندگان فعلی پادزهر (آنتی‌ونوم) سم مارها، برای به دست آوردن سم، مستقیماً از خود مارها سم استخراج می‌کنند. این فرآیند بسیار خطرناک است و جنکینز آن را مانند «دست زدن به یک نارنجک زنده» توصیف میکند. در این روش، مقدار کمی از سم به حیوانات بزرگی مانند اسب تزریق می‌شود و سپس آنتی‌بادی‌های تولید شده توسط این حیوانات استخراج می‌شود.
🔬جنکینز و بیکر با همکاری یکدیگر از یک مدل هوش مصنوعی به نام RFdiffusion استفاده کردند تا پروتئین‌های سفارشی طراحی کنند. این ابزار شبیه به هوش‌های مصنوعی است که تصاویر تولید می‌کنند، اما به جای ایجاد تصویر، می‌تواند ساختارهای پروتئینی طراحی کند که دقیقاً با مولکول‌های هدف (مانند سموم مارها) مطابقت دارند.
بیکر و جنکینز از این هوش مصنوعی خواستند تا پروتئین‌هایی طراحی کند که به سموم مارها بچسبند. سپس این پروتئین‌ها در آزمایشگاه ساخته شدند. این پروتئین‌ها مانند یک کلاه مغناطیسی عمل می‌کنند که نوک یک کلید را می‌پوشاند و مانع از باز کردن قفل می‌شود. به همین ترتیب، پروتئین‌های طراحی شده توسط هوش مصنوعی از اتصال سموم به سلول‌های بدن جلوگیری کرده و آن‌ها را بی‌خطر می‌کنند.
☠️یکی از خطرناک‌ترین اجزای سم مارها، سموم سه‌انگشتی (3FTx) هستند که می‌توانند باعث آسیب‌های بافتی شدید و اختلال در عملکرد سیستم عصبی شوند. در حال حاضر، تنها درمان موجود برای نیش مارها، استفاده از آنتی‌بادی‌های پلی‌کلونال است که از حیوانات ایمن‌شده استخراج می‌شوند. این روش نه تنها هزینه‌بر است، بلکه کارایی محدودی در خنثی‌کردن سموم سه‌انگشتی دارد.
در این مطالعه، محققان از روشهای یادگیری عمیق و هوش مصنوعی برای طراحی پروتئین‌هایی استفاده کردند که به سموم عصبی و سیتوتوکسین‌های خانواده 3FTx متصل می‌شوند. این پروتئین‌ها با دقت بالا طراحی شدند و در آزمایش‌های اولیه، توانستند سموم را به طور مؤثر خنثی کنند و موش‌ها را از مرگ نجات دهند. این پروتئین‌ها نه تنها پایدار و قوی هستند، بلکه به راحتی قابل تولید نیز می‌باشند. این دستاورد می‌تواند پایه‌ای برای تولید نسل جدیدی از پادزهرها باشد که ایمن‌تر، ارزان‌تر و در دسترس‌تر هستند.
✔️منبع #خبر
🧬در کانال آکادمی زیست اومیکس با ما همراه باشید…
| @BioOmics_Academy |
14.04.202512:36
👨💻رمزگشایی کد‌های حیات: پایگاه‌های داده ضروری در بیوانفورماتیک و اومیکس
💻برای شروع فعالیت در زمینه بیوانفورمایتک ابتدا لازم است که با دیتابیس‌های مهم آشنا شوین!
📌در ادامه مهم‌ترین دیتابیس‌ها را بررسی خواهیم کرد:
. GenBank (NCBI)
. UniProt
. Protein Data Bank (PDB)
. European Nucleotide Archive (ENA)
. Gene Expression Omnibus (GEO)
. KEGG (دایرةالمعارف کیوتو از ژنها و ژنومها)
. Ensembl
. Pfam
🔍چرا این پایگاه های داده مهم هستند؟
این منابع ستون فقرات زیست شناسی مدرن‌اند و به محققان امکان می‌دهند:
🔬توالی‌های ژنتیکی گونه‌های مختلف را مقایسه کنند.
💊داروها را با استفاده از ساختارهای سه بعدی مولکولی طراحی کنند.
🧬ارتباط ژن-بیماری را از طریق داده‌های اُمیک کشف کنند.
🌍داده‌ها را به‌صورت آزاد به اشتراک بگذارند تا علم جهانی سرعت گیرد.
🧬در کانال آکادمی زیست اومیکس با ما همراه باشید…
| @BioOmics_Academy |
💻برای شروع فعالیت در زمینه بیوانفورمایتک ابتدا لازم است که با دیتابیس‌های مهم آشنا شوین!
📌در ادامه مهم‌ترین دیتابیس‌ها را بررسی خواهیم کرد:
. GenBank (NCBI)
✏️تمرکز: توالی‌های نوکلئوتیدی (DNA/RNA).
⏺مرور: یک پایگاه داده پایه ای از مرکز ملی اطلاعات زیست فناوری آمریکا (NCBI)، بخشی از همکاری بینالمللی پایگاه های توالی نوکلئوتیدی (INSDC). توالی‌های حاشیه نویسی شده تمام گونه‌های زیستی را که توسط محققان سراسر جهان ثبت شدهاند، ذخیره میکند. با ابزارهایی مانند BLAST برای همترازی توالی ها یکپارچه شده است.
. UniProt
✏️
تمرکز: توالی‌های پروتئینی و داده‌های عملکردی.
⏺
مرور: منبعی جامع که Swiss-Prot (داده‌های دستیاری شده با تفسیرهای کیفی) و TrEMBL (ترجمههای خودکار توالی های DNA) را ترکیب میکند.
شامل جزئیاتی درباره عملکرد، ساختار و تعاملات پروتئین هاست
.
. Protein Data Bank (PDB)
✏️
تمرکز: ساختارهای سه بعدی مولکول‌های زیستی.
⏺
مرور: مخزن جهانی ساختارهای تجربی پروتئین ها، اسیدهای نوکلئیک و کمپلکس ها. ا
ز روشهای بلورشناسی اشعه ایکس، NMR یا میکروسکوپ الکترونی کرایو (cryo-EM) استفاده میکند. برای زیست شناسی ساختاری و طراحی دارو حیاتی است
.
. European Nucleotide Archive (ENA)
✏️
تمرکز: داده‌های خام توالی یابی.
⏺
مرور: معادل اروپایی GenBank تحت نظر EMBL-EBI و بخشی از INSDC.
داده‌های خام توالی یابی (مثلاً از Illumina یا PacBio) و ژنوم های سر هم بندی شده را ذخیره میکند
. از تکرارپذیری پژوهش‌های ژنومیک پشتیبانی میکند.
. Gene Expression Omnibus (GEO)
✏️
تمرکز: داده‌های بیان ژن و اپیژنومیک.
⏺
مرور:
مخزن NCBI برای داده های پرحجم ( RNA-seq، ChIP-seq
). امکان تحلیل‌های فرا داده از تنظیم ژنها در بیماری‌ها و شرایط مختلف را فراهم میکند.
. KEGG (دایرةالمعارف کیوتو از ژنها و ژنومها)
✏️
تمرکز: مسیرهای متابولیک، بیماری‌ها و تعاملات شیمیایی.
⏺
مرور:
داده‌های سیستم‌های زیستی مانند مسیرهای متابولیک/سیگنالینگ، ارتباط ژن-بیماری و اهداف دارویی را یکپارچه میکند
. منبعی کلیدی برای زیستشناسی سامانه‌ها و تحلیل شبکه‌ها.
. Ensembl
✏️
تمرکز: حاشیه نویسی ژنومها و ژنومیک تطبیقی.
⏺
مرور: پلتفرم EMBL-EBI
برای ارائه ژنوم های حاشیه نویسی شده مهره داران و موجودات مدل.
شامل مرورگر‌های ژنومی، پیش‌بینی اثر واریانت‌ها و ابزارهای بررسی تکاملی است.
. Pfam
✏️
تمرکز: خانواده‌ها و دامنه‌های پروتئینی.
⏺
مرور:
پایگاه دادهای از دامنه
های پروتئینی هم ترازی شده و مدلهای مارکوف پنهان (HMM)
. به شناسایی نواحی عملکردی در پروتئین‌های ناشناخته کمک میکند.
🔍چرا این پایگاه های داده مهم هستند؟
این منابع ستون فقرات زیست شناسی مدرن‌اند و به محققان امکان می‌دهند:
🔬توالی‌های ژنتیکی گونه‌های مختلف را مقایسه کنند.
💊داروها را با استفاده از ساختارهای سه بعدی مولکولی طراحی کنند.
🧬ارتباط ژن-بیماری را از طریق داده‌های اُمیک کشف کنند.
🌍داده‌ها را به‌صورت آزاد به اشتراک بگذارند تا علم جهانی سرعت گیرد.
🧬در کانال آکادمی زیست اومیکس با ما همراه باشید…
| @BioOmics_Academy |
12.04.202504:46
⏺آغاز به کار انجمن علمی زیست اومیکس
✅انجمن علمی زیست اومیکس، به عنوان مرجع فعالیت‌های آموزشی و پژوهشی در این حوزه آغاز به کار کرد.
این انجمن در زمینه انتشار محتواهای آموزشی، برگزاری کارگاه‌های پژوهشی و آموزشی، اجرای طرح‌های پژوهشی زیر نظر اعضای برجسته هیئت علمی دانشگاه‌های داخلی و خارجی، حمایت از پایان‌نامه‌های دانشجویی، ارتباط با صنعت و فناوری، توسعه دانش در این حوزه و ... فعالیت خواهد کرد.
🧬در کانال آکادمی زیست اومیکس با ما همراه باشید…
| @BioOmics_Academy |
✅انجمن علمی زیست اومیکس، به عنوان مرجع فعالیت‌های آموزشی و پژوهشی در این حوزه آغاز به کار کرد.
این انجمن در زمینه انتشار محتواهای آموزشی، برگزاری کارگاه‌های پژوهشی و آموزشی، اجرای طرح‌های پژوهشی زیر نظر اعضای برجسته هیئت علمی دانشگاه‌های داخلی و خارجی، حمایت از پایان‌نامه‌های دانشجویی، ارتباط با صنعت و فناوری، توسعه دانش در این حوزه و ... فعالیت خواهد کرد.
🧬در کانال آکادمی زیست اومیکس با ما همراه باشید…
| @BioOmics_Academy |
Гісторыя змяненняў канала
Увайдзіце, каб разблакаваць больш функцый.
